Home / Summaries / Molecular Diagnostics Fundamentals, Methods and Clinical Applications / str-geanalyseerd-pcr

DNA Polymorphisms and Human Identification

Q: Wat is short tandem repeat (STR) structuur en nomenclature?

STRs zijn herhalingen van nucleotidensequenties . Verschillende allelen bevatten verschillende aantallen repeats. STR-allelen kunnen worden geanalyseerd op amplicon-grootte met multiplex-PCR . Allelische ladders zijn standaarden die alle allelen in een populatie representeren. De resultaten kunnen worden geanalyseerd op gel of CGE. STR-genotypen zijn erfelijk. STR's worden ontworpen op basis van hun gen-naam. TH01 bevindt zich bijvoorbeeld in intron 1 van het humane tyrosinehydroxylase-gen op chromosoom 11, en TPOX bevindt zich in intron 10 van het humane schildklierperoxidase-gen op chromosoom 2. Deze STR's hebben geen enkel fenotypisch effect met betrekking tot deze genen. Niet-gen-geassocieerde STR's worden aangeduid door het D#S#-systeem. D staat voor DNA, het volgende nummer geeft het chromosoom aan waar de STR zich bevindt (1-22, X of Y). S verwijst naar een uniek segment, gevolgd door een nummer geregistreerd in de International Genome Database (GDB).

Q: Wat zijn mitochondriale DNA-polymorfismen?

Mitochondriën worden van de moeder geërfd . Alle maternale familieleden zullen dezelfde mitochondriale sequenties hebben. Er zijn gemiddeld 8,5 basenverschillen in de mitochondriale HV-sequenties (hyper variabel) van niet-verwante individuen. Mitochondriale typering kan worden gebruikt voor wettelijke uitsluiting van individuen of bevestiging van moederlijke afstamming .

6 important questions on DNA Polymorphisms and Human Identification

Wat is short tandem repeat (STR) structuur en nomenclature?

STRs zijn herhalingen van nucleotidensequenties. Verschillende allelen bevatten verschillende aantallen repeats.
STR-allelen kunnen worden geanalyseerd op amplicon-grootte met multiplex-PCR. Allelische ladders zijn standaarden die alle allelen in een populatie representeren. De resultaten kunnen worden geanalyseerd op gel of CGE. STR-genotypen zijn erfelijk.

STR's worden ontworpen op basis van hun gen-naam. TH01 bevindt zich bijvoorbeeld in intron 1 van het humane tyrosinehydroxylase-gen op chromosoom 11, en TPOX bevindt zich in intron 10 van het humane schildklierperoxidase-gen op chromosoom 2. Deze STR's hebben geen enkel fenotypisch effect met betrekking tot deze genen. Niet-gen-geassocieerde STR's worden aangeduid door het D#S#-systeem. D staat voor DNA, het volgende nummer geeft het chromosoom aan waar de STR zich bevindt (1-22, X of Y). S verwijst naar een uniek segment, gevolgd door een nummer geregistreerd in de International Genome Database (GDB).

Hoe kunnen STR-polymorfismen worden geanalyseerd?

STR allelen kunnen worden geanalyseerd op amplicon grootte (PCR).

Hoe kan met behulp van Southern blot het bandenpatroon van diploïde individuen worden uitgewerkt en RFLPs worden opgespoord?

Southern blot kan DNA-fragmenten analyseren op basis van grootte en sequentie.

DNA-extractie
Restrictie-enzymbehandeling
Gel-elektroforese
Overdracht naar membraan
Hybridisatie met probe: herkent RFLP
Detectie

Hoe kan STR polymorfismen analyse door PCR plaatsvinden?

Gel of capillary gelelektroforese
STR genotypen worden overgeërfd

Wat zijn mitochondriale DNA-polymorfismen?

Mitochondriën worden van de moeder geërfd.
Alle maternale familieleden zullen dezelfde mitochondriale sequenties hebben.
Er zijn gemiddeld 8,5 basenverschillen in de mitochondriale HV-sequenties (hyper variabel) van niet-verwante individuen.
Mitochondriale typering kan worden gebruikt voor wettelijke uitsluiting van individuen of bevestiging van moederlijke afstamming.

Wat is detectie van KSS mitochondriale deletie mutatie met Southern Blot?

Detectie van de KSS (Kearns-Sayre Syndrome) mitochondriale deletie mutatie met Southern Blot is een methode om de aanwezigheid van grote deleties in het mitochondriale DNA (mtDNA) te detecteren.