Basisregels voor primer-design werking van primers in de PCR - Smelttemperatuur en annealingstemperatuur van primers

4 belangrijke vragen over Basisregels voor primer-design werking van primers in de PCR - Smelttemperatuur en annealingstemperatuur van primers

Waarom is het zo belangrijk om primers te vinden met een passende Ta?

  • Bij een te hoge Ta kunnen primers niet binden en zal er geen product worden gevormd.
  • Bij een te lage Ta kunnen de primers op meerdere aspecifieke plekken aan het target DNA binden en zorgen voor de vorming van ongewenste PCR producten

Waarom wordt bij het uitvoeren van een PCR de laagste Tm het uitgangspunt zijn voor het bepalen van de Ta?

Als je de hoogste Tm zou pakken en je zou daar 5 graden vanaf halen, zou het voor de primer met de laagste Tm nog een te hoge Ta zijn, waardoor dan die laagste primer niet goed gebonden kan worden.

Wat is het verschil tussen stacking en nearest neighbor effect?

Stacking geeft het stabiliserende effect van de krachten aan op de Tm van opeenvolgende basen en de nearest neighbor-effect wordt het effect van neucleotide op het naastgelegen nucleotide genoemd.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Waarom wordt er door programma's die primers voor je bepalen vaak met de thermodynamica gerekend bij het bepalen van de Tm?

Dit omdat ook de aromatische ringen van opeenvolgende basen effect hebben op de Tm en dit in de andere twee formules (marmer en de wallace) niet wordt meegenomen.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo