DNA en chromosonen - DNA compactering

11 belangrijke vragen over DNA en chromosonen - DNA compactering

Het genoom, waar, hoeveel in mens en verhouding complexiteit en grootte genoom?

    • Nucleair, chloroplast en mitochondrion
    • 3,2 miljard in haploid, X2 in diploid
    • meer basenparen betekent niet perse iets, kan ook veel niet coderend DNA zijn

Bacterieel DNA welke soorten en hoe gecompacteerd?

-enkele chromosnen meestal circulair
- gebonden aan eiwitten die in de nucleoid zitten
-supercoiled en in loops, loops uiteinden geankerd aan die eiwitten, supercoiling geen invloed op de loops
-topo isomerase breekt de loops niet, alleen RNAse want  loops worden op plaats gehouden door RNAs en eiwitten

Er zijn ook nog plasmiden: circulaire moleculen die autonome replicatie (tegelijk met andere replicatie)  hebben en cellulaire functies
  • vormen
    • F fertility
    • R resistence
    • col : coline doden andere bacteriën
    • virulence : toxines om ziektes te veroorzaken en weefsels te beschadigen, of bacterie in cel toe te laten
    • metabole: enzymen
    • kryptische: geen idee

DNA compactering: histonen enzo

Histonen zijn positief geladen eiwitten door lysine en arganine
bindt zo met negatief geladen DNA vormt octomeer
5 vormen H1 H2a H2B H3 H4
Octomeer: 4 verschilllende H2 a en b H3 H4 X 2
histonstaart voor covalente modificatie die compactering verandert.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Wat zijn Stellage eiwitten?

Naast DNA en histonen bestaat een chromosoon ook uit stellage eiwitten, deze zorgen voor de structuur, ze dienen als een kapstok voor de structuur

Samenstelling van het eukaryoot domein

  • 1,5 procent exons: rRNA of tRNA
  • 24 procent introns: worden vertaald maar nooit gebruikt eruit geknipt ofzo, non coding
  • 15 procent non coding unique DNa: codeert wel maar niet verklaard
  • Repeated DNA 2/3
    • Tandemly repeated 15 procent
    • verspreid repeated 44 procent
      • transposons
        • LINEs 20 procent
        • SINEs
          • Alu 10 procent
      • retrotransposons


Junk DNA 3/4de= non coding unique DNA + Repeated

Verschil hetero en euchromatine en waar vind je heterochromatine?

  • Heterochromatine
    • zwarte stippen
    • 700 nm
    • niet te gebruiken voor transcriptie
      • facultatief: soms ook euchromatine
      • constitutief: nooit gebruikt voor transcriptie zoals de telomeren en centromeren
        • telomeer:
          • TTAGGG 250-1500 keer
          • uiteinden chromosonen
          • geen degradatie tijdens replicatie
        • centromeer
          • wordt samengehouden door complex proteïnen
          • kinetochoren binden hierop
          • CENsequentie: hoogrepetitief unieke DNA sequentie
          • Geen H3 histonen maar CENP-A histonen
  • euchromatine
    • los en transcriptie actief
    • pg 750
    • veel in metabolische cellen

G banden, hoe zien en belang?

Giemsa kleuring, enzym trypsine kleurt banden
gezond en ongezond

Verband tussen hoeveelheid DNA en snelheid renaturatie?

Meer DNA sneller renatureren
Meer DNA  meer repetitief DNA complementaire strengen vinden elkaar sneller

Repeated DNA onderverdeling

  • Tandem 15
    • lengte: 1-200 bp
    • sattelite
      • gewoon
      • mini 10-100 (centromeren en telomeren)
      • micro 1-10
    • 100-100000 kopieen
  • Verspreid 25-50
    • lengte 100-10000
    • 100 tot 1 M per genoom
    • random plekken
    • transposons
      • SINEs short interspersed nuclear elements
        • minder dan 500 bp
        • ALU word 1 miljoen keer herhaald
        • gebruik transposase en reverse transcriptase
      • LINEs long interspersed nuclear elements
        • 6000-8000bp
        • 20 procent
        • zorgen voor enzymen die kopieren en veplaatsen
        • transposase aanmaak
    • retrotransposons: zelf replicatie, reverse transcriptase

Vergelijking Transposons en retrotransposons

Verspreid repepetitief DNA

  • Transposons 
    • jumping genes
    • afkomstig van virussen
    • worden verplaatst
    • maken enzymen die kopiën maken en transposons ergens anders plaatsen
  • Retrotransposons
    • afkomstig van retrovirussen
    • wordt getranscripteerd door RNA polymerase
    • reverse transcriptase maakt er een nieuw DNA van dat ergens anders wordt geïnsireerd.

CHROMOSONE PAINTING WAT EN WAT BEWEZEN?

Adhv een soort van fish, wordt de ligging van de chromosonen duidelijk per chromosoon, in de interfase hebben ze elk hun eigen locatie, daarnaast maakt het ook translocaties zichtbaar

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo