DNA - DNA replicatie in bacteriën

15 belangrijke vragen over DNA - DNA replicatie in bacteriën

Wat is de replication fork?

De Y-vormige structuur waar het DNA wordt gerepliceerd. Wanneer deze zijn werk doet in bacteriën ontstaat er uiteindelijk de Griekse letter 'Theta'  θ.

Bij E. Coli vind de replicatie bidirectioneel plaats.

De replicatie van E. Coli DNA vereist op zn minst 10 eiwitten om het grote complex, het replisome te vormen. Wat is een replisome? Welk belangrijk eiwit zit hierin?

Een groot eiwitcomplex dat de dubbele DNA-helix kopieert om twee dochterchromosomen te vormen. In dit replisome zit onder andere het eiwit DNA polymerase -> enzym dat nieuw DNA synthetiseert met behulp van een ouderlijke nucleïnezuurstreng (meestal DNA) als sjabloon.

Welke 3 dingen heeft DNA polymerase nodig om synthese te katalyseren?

1. Een template strand die leest van de 5' naar 3' richting.
2. Een primer die zorgt voor een vrije hydroxylgroep op de 3'.
3. De 4 types dNTPs -> A, T, G en C.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

E. Coli heeft vijf verschillende DNA-polymerases. Welke is de belangrijkste?

DNA polymerase 3 heeft de grootste rol in replicatie, maar DNA polymerase 1 assisteert hierbij.


DNA polymerase 3 heeft een holoenzyme die bestaat uit 3 core enzymen, deze zitten vast aan de clamp loader.

Waar zijn helicases verantwoordelijk voor?

Enzymen die ATP-energie gebruiken om DNA af te wikkelen vóór de replicatievork.

Waar zorgen single stranded binding proteins voor?

Die zorgen ervoor dat de twee DNA strengen uit elkaar blijven wanneer deze gescheiden zijn.

Wat is het primosome? (primase is hier een onderdeel van)

In bacteriën, een complex van eiwitten dat het enzym primase omvat, verantwoordelijk voor het synthetiseren van de RNA-primers die nodig zijn voor DNA-replicatie.

Wat zijn de leading en lagging strand?

Leading strand: De DNA-streng die continu wordt gesynthetiseerd tijdens DNA-replicatie.

Lagging strand: De DNA-streng wordt niet continu gesynthetiseerd tijdens DNA-replicatie. Dit komt omdat er op de 3' geen vrije OH-groep is.

synthese gebeurt van 5' naar 3'.

Wat zijn Okazaki fragmenten en wat is hier het voordeel van?

Korte stukken polynucleotiden geproduceerd voor de lagging strand tijdens DNA-replicatie. Er worden dus heel veel primers op de template strand gebouwd. DNA polymerase 3 kan deze primers verlengen met DNA -> zo groeien de fragmenten aan elkaar en heb je een complete strand.

Op welke specifieke locus start de replicatie van E. Coli?

De oriC locus (origin of chromosomal replication). Deze plek is AT rijk. DnaA-eiwitten binden regio's in oriC gedurende de celcyclus, maar om replicatie op gang te brengen, moeten DnaA-eiwitten een paar specifieke oriC-sequenties binden.  Door de aanwezigheid van DnaA op deze locaties wordt een helicase (meestal DnaB-helicase) gerekruteerd naar de oorsprong.

DNA polymerase 3 heeft nog een heel belangrijke functie, namelijk proofreading. Wat houdt dit in?

Het vermogen van enzymen om hun producten te controleren om er zeker van te zijn dat het juiste product wordt gemaakt.  DNA-polymerase controleert bijvoorbeeld nieuw gesynthetiseerd DNA en vervangt een onjuist nucleotide door het juiste voorafgaand aan verdere synthese. Het verwijderen van een verkeerd nucleotide gebeurd door exonuclease.

Ongeacht hoe de beweging van de vork wordt gestopt, er zijn twee problemen die door de replisome moeten worden opgelost. De eerste is de vorming van in elkaar grijpende chromosomen, Wat zijn 'catenated chromosomes'?

Circulaire, covalent gesloten nucleïnezuurmoleculen die aan elkaar zijn vergrendeld als de schakels van een ketting. Ze ontstaan wanneer topoisomerases breken en zich weer aansluiten bij DNA-strengen om supercoiling vóór de replicatievork te vergemakkelijken.

Daarnaast heeft het replisome nog een ander probleem dat moet worden opgelost, namelijk gedimerizeerde chromosomen. Wat betekent dit?

twee chromosomen zijn samengevoegd om een ​​enkel chromosoom te vormen dat twee keer zo lang is.

Wat is het einde replicatie probleem?

Wanneer de RNA-primer voor het Okazaki-fragment aan het 5'-uiteinde van de dochterstreng wordt verwijderd, is het dochtermolecuul korter dan het moedermolecuul.  Na talloze rondes van DNA-replicatie en celdeling leidt dit tot een progressief verkort chromosoom.  Uiteindelijk verliest het chromosoom kritische genetische informatie, die dodelijk is voor de cel.  Dit wordt het "eindreplicatieprobleem" genoemd en een cel moet het oplossen om te overleven.

Hoe gaat de bacterie Borrelia burgdorfi om met het einde replicatie probleem?

Borrelia burgdorfi heeft na replicatie hairpins, waardoor het DNA circulair is en het heeft dus geen uiteindes.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo