Samenvatting: Biochemie

Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van Biochemie

• 1 Inleiding tot de biochemie

• Geef alle functionele groepen weer

  Functionele groepen

• Geef de structuur van een zuuranhydride weer

  Zuuranhydride

• 2 Chemie in waterige omgeving

• Weet je dat biochemie zich in een waterig milieu afspeelt

  - Levende organismen komen in de meest extreme omgevingen voor. Er is maar 1 absolute voorwaarde: aanwezigheid water!
  - Meeste organismen bestaan uit minimum 70 % water.
  - De structurele en chemische eigenschappen van water beïnvloeden in grote mate de biochemische structuren en processen:
  o Water doet dienst als oplosmiddel
  o Water beïnvloedt de structuur en functie van biomoleculen
  o Water speelt een rol in assemblage van macromoleculen
  o Dissociatie-producten van water (H+ en OH-) nemen rechtstreeks deel aan biochemische processen

• 2.3 pH een belangrijke parameter in biologische systemen

• Ken je de begrippen pH, zuurdissociatieconstante

  pH - zuursterkte
  - De pH wordt gedefinieerd als de negatieve logaritme van de concentratie protonen.
  o neutrale oplossing = -log (10-7 ) = 7
  o zure oplossing met [H+ ] > 10-7 M, pH < 7
  o basische oplossing met [H+ ] < 10-7 M; pH > 7
  zuurdissociatieconstante - Sterke zuren en basen zijn volledig geïoniseerd in waterige oplossingen.
  - Zwakke zuren en basen zullen maar gedeeltelijk ioniseren in water. De evenwichts constante is hier van belang.

• 2.3.1 Ionisatie van water, zwakke zuren en basen

• Kan je de biochemische betekenis van een pK waarde uitleggen + Kan je de correlatie tussen pH en dissociatie van zwakke zuren uitleggen a.d.h.v. de Henderson-Hasselbalch vergelijking

  - In de biochemie worden zuren gedefinieerd als moleculen die bij ionisatie een proton en een base opleveren. De gevormde base wordt dan een geconjugeerde base genoemd.
  - Ka is de zuurconstante. Dit is een evenwichtsconstante die een maat is voor de sterkte van een zuur. Hoe groter de Ka waarde, hoe sterker het zuur.
  - Hoe hoger de Ka-waarde, hoe lager pKa, hoe groter de ‘zuursterkte’. De finale concentratie aan protonen, of dus de pH, is afhankelijk van de ionisatie van zuur.
  - Henderson-Hasselbalch vergelijking. pH = pKa + log ( [A −] / [HA] )

• 3 Eiwitten

• 3.2.1.1 Chemische structuur

  Dit is een preview. Er zijn 5 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 3.2.1.1
  Laat hier meer flashcards zien

• Begrijp je wat pK waarden van de functionele groepen in aminozuren betekenen

  - De pK-waarden van de functionele groepen komen telkens overeen met de pH-waarde waarbij de helft van de functionele groepen geïoniseerd is.
  - aminozuren met niet-ioniseerbare zijketen
  o pKa1 de dissociatieconstante van de carboxylgroep
  o pKa2 de dissociatieconstante van de aminogroep
  - Bij aminozuren met ioniseerbare zijketen
  o pKa1 dissociatieconstante carboxylgroep (pK1)
  o pKa2 dissociatieconstante aminogroep (pK2)
  o pKaR dissocatieconstante R-keten (pKR)

• Kan je pI waarden van aminozuren berekenen op basis van pK waarden

  - iso-elektrisch punt of pI:
  o pH-waarde waarbij de netto-lading van het aminozuur nul is
  o form: pI = (1 / 2) * (pKa1 + pKa2 )

• 3.3.2 Lading van peptiden

  Dit is een preview. Er zijn 4 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 3.3.2
  Laat hier meer flashcards zien

• Heb je inzicht in de stereochemie van aminozuren

  - Aminozuren zijn allemaal chiraal
  - L-α-aminozuren bevorderen een rechtsdraaiende helixstructuur.

• 3.6.2 Denaturatie door chemische factoren

• Denaturatie door chemische factoren

  - Veranderingen in pH hebben een impact op de lading van een eiwit
  - Door veranderingen in lading, kunnen elektrostatische afstotingskrachten ontstaan of H-bruggen verbroken worden.
  - Bepaalde chemicaliën (chaotrope agentia) zullen een impact hebben op de niet-covalente interacties die de 3D-structuur van een eiwit bepalen (bv ureum)

• 4 Koolhydraten

• 4.2.4.1 Circularisatie en Haworth perspectief formules

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 4.2.4.1
  Laat hier meer flashcards zien

• Kan je op basis van Fisher- projectie een Haworth perspectiefformule weergeven en omgekeerd

  Stappenplan