Contaminatie problematiek

8 belangrijke vragen over Contaminatie problematiek

Wat zijn mogelijke bronnen van contaminatie?

  • Micro-organismen (ziekteverwekkers) zelf, aanwezig in de andere klinische monsters op het laboratorium.
  • Plasmide klonen afkomstig van micro-organismen die eerder geanalyseerd zijn op het laboratorium.
  • PCR producten (amplimeren) uit eerdere experimenten als het monster positief was.
  • Op microbiologisch laboratoria: andere testen b.v. complement bindingsreactie (of andere reactie waarbij antigenen gebruikt worden: deze bevatten vaak veel DNA).

Waarmee worden oppervlaktes schoongemaakt in een laboratorium?

  • bleekwater
  • loog 
  • extran
  • HCL

Welke criteria zijn van belang bij amplicon sterilisatie?

  • Het PCR cupje (van dag 1) mag niet opengaan vóórdat de verandering in het DNA product van het amplicon is aangebracht (om het te kunnen onderscheiden van DNA van het nieuwe monster van dag 2.
  • Door de aangebrachte verandering mag het amplicon DNA van dag 1 niet dusdanig kapot zijn gegaan dat het niet meer in een detectieprocedure aangetoond kan worden (b.v. gelelektroforese of een Southern blot).
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Wat is het verschil tussen pre en post amplificatie amplicon sterilisatie?

  • Pre (vóór) amplificatie amplicon sterilisatie betekent dat de bestaande amplicons kapot gemaakt (gesteriliseerd) worden vóór dat er een nieuwe amplificatie wordt gedaan. Dit gebeurt dus voordat de nieuwe PCR gedaan wordt.
  • Post (erna) amplificatie amplicon sterilisatie betekent dat de amplicons die gemaakt zijn direct ná de amplificatie gesteriliseerd worden, dus direct na de PCR

Wat is de reden voor het bestralen met UV-licht?

  • Leidt tot de vorming van pyrimidine-dimeren (thymine).
  • thymine gecrosslinkt.
  • geen substraat meet voor Taq-DNA polymerase.
  • amplicons kunnen niet nogmaals vermenigvuldigd worden.

Hoe werkt het bestralen met UV-licht?

Cupje dag 2 met daarin alle PCR reactie componenten behalve het target (monster 2) en de primers blootgesteld aan UV-licht voor 5-20 minuten.
Hierna worden pas het target DNA (monster 2) en de primers toegevoegd.

Hoe werkt de in activatie van nucleïnezuren met furocoumarines?

  • Furocoumarines vooraf aan de PCR toegevoegd.
  • na afloop PCR geactiveerd wanneer samples bestraald worden met UV licht.
  • forucomarines binden aan pyrimidines.
  • PCR amplicons geïnactiveerd.
  • DNA kan niet meer als template dienen voor PCR.

Hoe werkt het gebruik van gemodificeerde primers?

  • Bevatten een of meerdere ribose residuen i.p.v. Desoxyribose residuen aan het 3'OH uiteinde.
  • primers gevoeliger voor hydrolyse bij behandeling NaOH.
  • tijdens PCR ingebouwd en vormen onderdeel, gevormde amplicons.
  • primers afgebroken door NaOH behandeling aan uiteindes amplicons.
  • geen bindingplekken voor nieuwe primers.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo