Genomics - basic bioinformatics - read mapping, align reads to reference sequences
3 belangrijke vragen over Genomics - basic bioinformatics - read mapping, align reads to reference sequences
Wat zijn secondary alignment?
- Als een read op meerdere ekan mappen.
- een read met veel secondary alignment heeft een lage MAPQ
Hoe indentificeerd je een duplicate reads?
- Die kan doordat een duplicate alignment de 5'-end coordinaten allemaal
het zelfde zijn en ook de orientatie
- ze beginnen en eidigen op de zelfde plek maar zijn niet identiek qua base identiek
- alleen de hoogste kwaliteit wortd behouden.
- duplicaten woorden gemarkeerd
Op basis van welke dingen zorgt je voor flitering van je reads?
- MAPQ
- locatie
- supplementary alignments
- duplicate reads
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
