Translatie en eiwitten
11 belangrijke vragen over Translatie en eiwitten
Bij een eiwitmolecule kunnen vier structuurniveaus onderscheiden worden:
- Primaire structuur: lineaire aminozuursequentie met peptidebindingen
- secundaire structuur: door H-bruggen tussen de COOH-groepen en NH2-groepen van de aminozuren. Meest voorkomende: alpha-helix en beta-sheet
- tertiaire structuur: 3D-vorm van 1 polypetide, verdere opvouwing van secundaire structuur
- quarternaire structuur: interactie tussen verschillende polypetiden die een multi-subeenheidstructuur vormen. Polypetiden kunnen gelijk of verschillend zijn.
Genen zijn colineair met de eiwitten waarvoor ze coderen
- Volgorde van de nt in het gen correleert direct met de volgorde van de AZ van het overeenkomstige proteine.
- bewijs: verandering van 1 nt leidt tot de wijziging van slechts 1 aminozuur --> wijst op niet overlappende code.
Kenmerken van genetische code
- Genetische code = triplet code
- combinatie van 3 basen = codon = aminozuur of stopsignaal
- deze code is (bijna) universeel
- ondubbelzinnig: 1 triplet komt overeen met 1 AZ
- degeneratie: meerdere codons mogelijk voor 1 AZ
- niet overlappend en geen interne punctuatie
- bij universaliteit: uitzonderingen codongebruik recombinant DNA
- start- en stop codons
- Hogere cijfers + sneller leren
- Niets twee keer studeren
- 100% zeker alles onthouden
Rol van tRNA in translatie
- Vertaalsleutels = transfer-RNAs (tRNA)
- tRNAs bevatten een anticodon = triplet van 3 basen complementair aan de codons in mRNA
- brengen de overeenkomstige aminozuren aan voor polymerisatie.
Adaptorrol van tRNA via codon-anticodon ineractie
- tRNA vormt via de complementaire anticodon de sleutel voor vertaling van de nt-volgorde naar de AZ-volgorde
- codeherkenning gebeurt door de anticodon van de tRNA-molecule. Dit is complementair aan het codon dat codeert voor het AZ en er kan zodoende basenparing plaatsvinden tussen codon en anticodon
- voor elk AZ is er minstens 1 specifiek tRNA
- iso-accepting tRNA's: verschillende tRNA's die hetzelfde AZ dragen
Wobble (zie fig. Slide 12)
- Eenzelfde tRNA herkent verschillende codons via de wobble
- er zijn maar slechts 31 tRNA's nodig
- wobble laat specifieke uitzonderingen toe op de wobble-positie
- inosine (I) = gemodificeerde base in anticodon dat kan paren met C, A en U.
- wordt gebruikt in probe of primer als bepaalde base ongekend is.
Elongatie van translatie in E. Coli (zie slide 24 voor figuur)
- Elongatie = methionine wordt van tRNAi overgezet op 2de tRNA
- Peptidebinding koppelt de aminozuren
- Peptidyltransferase = 23S-rRNA
- Translocatie: ribosoom verschuift 3 basen.
- Elongatiefactoren (EF) betrokken.
Terminatie van translatie in E. Coli
Translatieterminatie:
• Geen tRNA voor stopcodons
• Release factor (RF) bindt op stopcodon
• Loskomen van alle componenten
• Dissociatie ribosomen in 2 sub-eenheden
Verschillen in translatie tussen eukaryoten en prokaryoten
- Bij eukaryoten is er geen koppeling transcriptie-translatie
- monocistronische mRNA's ipv polycistronische maw gen operons
- Initiatie op startcodon na scannen van 5’cap (ribosoombindingsplaats bij eukaryoten) naar eerste AUG (startcodon), minstens 8 initiatiefactoren nodig.
- Eukaryotische mRNAs vormen een cirkel voor translatie waarbij de 5’CAP en de 3’polyA dicht tegen elkaar zitten en zo ook beschermd worden tegen afbraak.
- methionine op het tRNAi is niet geformyleerd
- voor elongatie zijn er slechts 2 elongatiefactoren nodig:
- eEF1 bindt aminoacyl-tRNA's
- eEF2 helpt bij translocatie
Mutante codons kunnen verschillende effecten hebben:
- Geen effect op AZ (silent)
- Ander AZ (missense) Effect afhankelijk van belang van dat AZ.
- Stopcodon (nonsense) Effect vnl. afhankelijk van plaats in eiwit.
Posttranslationele processing van eiwitten
- geknipt worden
- combineren met andere polypeptideketens
- geglycosyleerd worden
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden