Samenvatting: De Cell

Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van De cell

• 1 College 1, blz 233-245 The global structure of chromosomes

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1
  Laat hier meer flashcards zien

• 1.1 Chromosomes are folded into large loops of chromatin polytene chromosomes are uniquely useful for visualizing chromatin structures

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1.1
  Laat hier meer flashcards zien

• Met behulp van welke studies is de kennis van chromatine structuren van chromosomen in interfase opgedaan?

  Door studies in Lampbrush chromosomen bij amfibie oocyten.

• Wat zijn lampbrush chromosomen?

  Grote gepaarde chromosmen in meiose in immature amphibian effes, waarbij de chromatine grote stijve loops vormen die uitsteken vanaf de lineaire ax van het chromosoom.
  De structuur is georganizeerd in een serie van grote chromatine loops die uitsteken van de lineaire chromosomale ax. 

• Hoe ziet het model van de structuur van een lampbrush eruit?

  Het lampbrush chromosoom bestaat uit een as waaruit loops ontspringen. Elke specifieke loop bevat een specifieke DNA sequentie. 
  De loops hebben een meer open chromosoom stuctuur en bevatten specifieke genen die hier actief tot expressie komen.
  De meeste genen zitten echter in chromosomeren. Deze chromosomeren zitten aan weerskanten van de loop en bestaan uit hoog gecondenseerd chromatine. Hierdoor koemn de genen die hier zitten niet tot expressie.

• Wat is PCR en wat kun je met deze techniek doen?

  PCR staat voor polymerase chain reaction en is een techniek voor het amplificeren van specifieke DNA regio's door het gebruik van sequentie specifieke primers en verschillende cycli van DNA synthese, elke ronde wordt gevolgd door een hitte behandeling om complementaire strengen te scheiden. 

• Wat tonen experimenten met  lampbrush chromosomen aan voor de mechanismen in menselijke cellen?

  De experimenten met lampbrush chromosomen tonen aan dat deze vouwingsorganisatie een basis principe is wat suggereert dat DNA in menselijke chromosomen ook georganiseerd is in loops van verschillende lengte. 

• Hoe wordt chromatine nog sterker gevouwen tijdens mitose?

  Tijdens mitose vindt er nog een vouwings organisatie plaats bovenop de chromosomale loops waarbij condensin en DNA topoisomerase 2 enzymen een rol spelen.

• 1.2 polytene chromosomes are uniquely useful for visualizing chromatin structures

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1.2
  Laat hier meer flashcards zien

• Wat zijn polytheen chromosomen?

  Polytheen chromosomen zijn gigantische chromosomen waarbij het DNA veel herhaalde replicaties (10x) ondergaan heeft maar niet gedeeld heeft waardoor de vele kopieën (1024) bij elkaar gebleven zijn.

• Wat is de verhouding van DNA in bands en interbands bij polytene chromosmen?

  95% van het DNA zit in bands (zwart) en is zeer sterk gecondenseerd
  
  5% van het DNA zit in interbands (wit) en is in mindere mate gecondenseerd

• Wat is het patroon van histon modicificaties in Drosophila polytene chromosomes?

  Compact chromatine bevat de H3K9-dimethyl modificatie terwijl 
  Ontvouwen chromatine de H3K9-acetyl modificatie bevat.

• Wat zijn puffs en wat is hun functie bij polytene chromosome?

  Puffs zijn ontvouwen delen van het chromatine. Puffs ontstaan/verdwijnen tijdesn de larvale ontwikkeling van insecten doordat histon modificaties specifieke eiwitten aantrekken.
  Puffs in polytene-chromosomen zijn actief in RNA synthese en is dus essentieel voor de productie van specifieke eiwitten.