Protein interactions - Elektroforese analyse
3 belangrijke vragen over Protein interactions - Elektroforese analyse
Wat is een natieve polyacrylamidegel?
Een natieve gel wordt gebruikt om biomoleculen te scheiden zonder deze eerst te denatureren, wat betekent dat hun natuurlijke driedimensionale structuur behouden blijft.
- 'Natief' betekent dat de biomoleculen hun natuurlijke driedimensionale structuur en conformatie behouden.
Wat is de rol van het E. Coli CAP-eiwit in EMSA?
Het CAP-eiwit wordt vaak gebruikt als een voorbeeld van een eiwit dat DNA-bindende capaciteiten heeft en het kan dienen als een controle-eiwit om de effectiviteit van de assay te demonstreren. CAP-eiwit bindt lac promotor-operator regio.
Hoe laat je bij een band shift/EMSA assay zien dat het een specifieke interactie betreft? Wat zijn de controles?
Sequentie-specifieke experimenten.
- Vrij gelabelde DNA-probe + extract met DNA-bindend eiwit
- Binding van eiwit aan DNA-probe resulteert in band shift
- Ongelabeld DNA competitor (hetzelfde als de probe) en aspecifiek ongelabeld DNA worden meegenomen voor specificiteit
- Specifiek DNA toevoegen in overmaat (DNA van probe)
- Specifiek DNA kan worden weggecompeteerd met specifieke DNA competitor, dat geldt niet voor de aspecifieke DNA competitor (ongerelateerd, ongelabeld DNA)
- Extra controle: antilichaam gebruiken tegen het eiwit van interesse -> dit resulteert in een supershift
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
