Chromatography and proteomics - Chromatografie

10 belangrijke vragen over Chromatography and proteomics - Chromatografie

Wat zijn de verschillende systemen voor scheidingsmethoden?

  • Vloeistofchromatografie (LC)
  • Gaschromatografie (GC)

Voor de scheiding van eiwitten wordt meestal gebruikt gemaakt van vloeistofchromatografie.

Wat zijn de verschillende kolommen gebruikt in de vloeistof- versus gaschromatografie?

  • Vloeistofchromatografie (LC): mobiele fase is een vloeistof, bijv. HPLC. Kolom HPLC: 15cm x 4.6mm x 5micrometer.
  • Gaschromatografie (GC): mobiele fase is gas. Kolom GC: 30m x 0.25mm.
-> Kolom GC is langer en dunner dan LC kolom.

Wat is het verschil tussen LC en GC?

LC
  • Mobiele fase: vloeistof
  • Stationaire fase: oppervlak (kolom)
  • Analiet interacteert met beide fasen

GC
  • Mobiele fase: gas (draagt het analiet door de kolom)
  • Stationaire fase (oppervlak): interacteert met analiet
  • Hogere temperaturen, want gasfase: daardoor minder geschikt voor eiwitten, maar wel voor eiwitproducten of substraten/metabolieten. Voor kleinere en vluchtigere moleculen dan LC.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Wat zijn de componenten van een HPLC (en FPLC)?

Solvent bottles -> degasser -> pump -> mixer (gradiënt wordt geprogrammeerd) -> (injector) -> (autosampler) -> door kolom gepompt -> detector

Wat is het verschil tussen HPLC en FPLC?

Fast Protein Liquid Chromatography (FPLC)
  • HPLC wordt vaak gebruikt in chemische laboratoria
  • FPLC wordt vaker gebruikt voor biomoleculen (minder extreem, want de druk en de flow rate worden beperkt gehouden)

Wat zijn (de overeenkomsten tussen) RPC en HIC?

RPC en HIC lijken veel op elkaar:
  • De manier van scheiding is gelijk. Scheiding is afhankelijk/gebaseerd op verschillen in hydrofobiciteit.
  • Stationaire fase is hydrofoob, scheiding is gebaseerd op de hydrofobe moleculen die aan de kolom binden.
  • RPC wordt vooral gebruikt voor het scheiden van peptiden, eiwitten binden te sterk met de kolom wat scheiding bemoeilijkt.
  • Voor elutie moeten de hydrofobe interacties worden verbroken.
  • Mobiele fase: waterige oplossing
  • Elutie: sterker organisch apolair oplosmiddel

Wat is het stapsgewijs proces van RPC?

  1. Eiwitten (peptiden) worden gebonden aan de hydrofobe kolom (eiwitten zonder hydrofoob deel komen direct mee met het waterige oplosmiddel).
  2. Organisch oplosmiddel wordt verhoogd -> eiwit met minst krachtige hydrofobiciteit zal als eerste loslaten van de kolom.
  3. Wasstap met nog sterker organisch middel, voor wassen van de laatste deeltjes van de kolom.

Wat is Ion-Exchange Chromatography (IEC)?

Scheiding gebaseerd op lading.
  • Negatief geladen kolom (kationenwisselaar) bindt positieve ionen (kationen)
  • Vice versa voor anionen
  • pH belangrijk voor nettolading eiwitten (note pI waarde) -> spelen met pH waarde door gebruik te maken van de pI.
  • Elutie: toename van zoutconcentratie, pH verandering

Wat is gelpermeability chromatography (gelfiltration, size exclusion)?

Scheiding op basis van grootte.
  • Grote deeltjes migreren snel
  • Kleine deeltjes migreren langzaam
  • Ook; spin columns voor ontzouten

Wat zijn de verschillende detectiemethoden voor LC?

  • UV/Vis detector
    -> meet absorptie van licht (vaste of gevarieerde golflengte) -> eiwitten 280 nm absorptie m.n. tyrosine/tryptofaan
  • Fluorescence detector -> excitatie en meet emissie van licht
  • Electrochemical detector -> meet veranderingen in stroom/spanning (Volt) (amperometrisch)
    -> coulometrisch (chemische reactie)

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo