Chromatography and proteomics - Chromatografie
10 belangrijke vragen over Chromatography and proteomics - Chromatografie
Wat zijn de verschillende systemen voor scheidingsmethoden?
- Vloeistofchromatografie (LC)
- Gaschromatografie (GC)
Voor de scheiding van eiwitten wordt meestal gebruikt gemaakt van vloeistofchromatografie.
Wat zijn de verschillende kolommen gebruikt in de vloeistof- versus gaschromatografie?
- Vloeistofchromatografie (LC): mobiele fase is een vloeistof, bijv. HPLC. Kolom HPLC: 15cm x 4.6mm x 5micrometer.
- Gaschromatografie (GC): mobiele fase is gas. Kolom GC: 30m x 0.25mm.
Wat is het verschil tussen LC en GC?
- Mobiele fase: vloeistof
- Stationaire fase: oppervlak (kolom)
- Analiet interacteert met beide fasen
GC
- Mobiele fase: gas (draagt het analiet door de kolom)
- Stationaire fase (oppervlak): interacteert met analiet
- Hogere temperaturen, want gasfase: daardoor minder geschikt voor eiwitten, maar wel voor eiwitproducten of substraten/metabolieten. Voor kleinere en vluchtigere moleculen dan LC.
- Hogere cijfers + sneller leren
- Niets twee keer studeren
- 100% zeker alles onthouden
Wat zijn de componenten van een HPLC (en FPLC)?
Wat is het verschil tussen HPLC en FPLC?
- HPLC wordt vaak gebruikt in chemische laboratoria
- FPLC wordt vaker gebruikt voor biomoleculen (minder extreem, want de druk en de flow rate worden beperkt gehouden)
Wat zijn (de overeenkomsten tussen) RPC en HIC?
- De manier van scheiding is gelijk. Scheiding is afhankelijk/gebaseerd op verschillen in hydrofobiciteit.
- Stationaire fase is hydrofoob, scheiding is gebaseerd op de hydrofobe moleculen die aan de kolom binden.
- RPC wordt vooral gebruikt voor het scheiden van peptiden, eiwitten binden te sterk met de kolom wat scheiding bemoeilijkt.
- Voor elutie moeten de hydrofobe interacties worden verbroken.
- Mobiele fase: waterige oplossing
- Elutie: sterker organisch apolair oplosmiddel
Wat is het stapsgewijs proces van RPC?
- Eiwitten (peptiden) worden gebonden aan de hydrofobe kolom (eiwitten zonder hydrofoob deel komen direct mee met het waterige oplosmiddel).
- Organisch oplosmiddel wordt verhoogd -> eiwit met minst krachtige hydrofobiciteit zal als eerste loslaten van de kolom.
- Wasstap met nog sterker organisch middel, voor wassen van de laatste deeltjes van de kolom.
Wat is Ion-Exchange Chromatography (IEC)?
- Negatief geladen kolom (kationenwisselaar) bindt positieve ionen (kationen)
- Vice versa voor anionen
- pH belangrijk voor nettolading eiwitten (note pI waarde) -> spelen met pH waarde door gebruik te maken van de pI.
- Elutie: toename van zoutconcentratie, pH verandering
Wat is gelpermeability chromatography (gelfiltration, size exclusion)?
- Grote deeltjes migreren snel
- Kleine deeltjes migreren langzaam
- Ook; spin columns voor ontzouten
Wat zijn de verschillende detectiemethoden voor LC?
- UV/Vis detector
-> meet absorptie van licht (vaste of gevarieerde golflengte) -> eiwitten 280 nm absorptie m.n. tyrosine/tryptofaan - Fluorescence detector -> excitatie en meet emissie van licht
- Electrochemical detector -> meet veranderingen in stroom/spanning (Volt) (amperometrisch)
-> coulometrisch (chemische reactie)
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden