Mass spectrometry - Massaspectrometrie - Eiwitidentificatie met MS
10 belangrijke vragen over Mass spectrometry - Massaspectrometrie - Eiwitidentificatie met MS
Hoe ziet een Mass Spectrum van een intact eiwit eruit?
- kan slechts enkele kDa detecteren voor enkelvoudige geladen massa's
- meerdere ladingen op eiwitten mogelijk
- Geladen eiwitten met een hoger gewicht kunnen worden gemeten
- Extra proton opnemen veranderd de massa nihil, maar zorgt dat de m/z waarde halveert.
- Afhankelijk van de pH waarin het eiwit zich bevindt en de zijgroepen van het eiwit zullen eiwitten meerdere ladingen hebben.
Hoe gaat eiwitidentificatie met MS/MS in zijn werk?
- Begin met een mengsel van eiwitten
- Sequentiële scheiding in stappen; LC-MS/MS
- Scannen van ionen verschillende m/z-waarden
- Database zoeken
- Identificatie van peptiden
- Eiwit identificatie
Hoe gaat eiwitidentificatie met LC-MS/MS in zijn werk?
- Scheiding gebruikmakend van LC
- Eerste MS
- Collision cell
- Tweede MS
- Hogere cijfers + sneller leren
- Niets twee keer studeren
- 100% zeker alles onthouden
Voor mijn 1e tentamen haalde ik een 6. Toen ben ik gaan zoeken naar manieren om beter te leren en ben ik Study Smart tegen gekomen. Sindsdien heb ik een 9,0 - 8,0 - 7,6 - 8,0 - 8,0 gehaald. Ik raad het echt íédereen aan die het maar horen wil. Ik ben er zo blij mee!!
Met mijn oude methode was ik geslaagd voor maar 3 van de 8 vakken. Sinds ik mijn aantekeningen digitaal maak in study smart, ben ik voor alle vakken de éérste keer geslaagd. StudySmart neemt voor mij de stress van slagen of niet slagen weg.
Door StudySmart gaat het op zo veel vlakken beter met mij. Eerst had ik continu studiestress en ik had nergens tijd voor. Nu voel ik mij rustig en zelfverzekerd (door gebruik van het programma). Eerst haalde ik meestal een 7, nu vaak een 8 of zelfs een 9.
Hey Chris, ik wil je echt hartelijk danken voor het ontwikkelen van het platform. Ik haalde hiervoor altijd rond de 6/10 voor m'n tentamens, nu een 8,6, een 7,9 en een 7,6!!
Sinds ik Study Smart gebruik, is mijn gemiddelde 1 punt gestegen. Ik heb zelfs een statistisch vak met een 10/10 afgerond terwijl ik slecht ben in statistiek. Nu volg ik extra vakken omdat vorig jaar zo goed ging door Study Smart. Veel dank!
Sinds ik ben gaan leren met StudySmart ben ik geslaagd voor al mijn examens!!! Geen herexamens!! Eerst was ik al blij met een voldoende en nu haal ik alleen maar goede cijfers. Veel dank!
Ik heb alle vakken die ik met Study Smart heb geleerd gehaald. Met rechten ben ik van een 5 naar een 8 gegaan! Ik weet nu zeker dat ik al mijn vakken gewoon ga halen.
Ik dacht altijd dat ik goed studeerde. Mijn cijfers waren ook prima. Ik had mij nooit kunnen voorstellen dat ik zo veel beter en sneller zou studeren door het toepassen van deze vaardigheden.
Ik voel mij voor het eerst 100% zeker over de manier waarop ik leer. Ik heb nu het complete overzicht en de structuur die ik nodig had
Door Study Smart kreeg ik weer plezier in het studeren en haalde ik direct betere cijfers. Alles ging ineens beter. Ik raad Study Smart enorm aan aan scholieren en studenten.
Met dit plaform kan ik super snel en gestructueerd studeren. Ik ben nooit meer de weg kwijt in de stof of in mijn aantekeningen en maak veel sneller goede samenvattingen.
Eerst waren mijn aantekeningen een zooitje. Nu gebruik ik Study Smart en studeer ik super gestructureerd. Het helpt mij om tijd te besparen waardoor ik ook andere dingen kan doen die ik belangrijk vind.
Leerlingen die met het systeem hebben gewerkt hebben gewoon een beter resultaat behaald. Het systeem past alle leertrucjes zo toe, dat zowel de kinderen die goed scoren, maar ook zij die minder scoren, aan hun trekken komen.
Hey Chris, ik wil je enorm bedanken. Het vak waar ik vorig jaar nog net een 5,5 voor haalde, heb ik nu voor ditzelfde vak maar liefst een 9,7 gehaald! Mede dankzij jouw methode! Heel erg bedankt!
Het grootste effect is dat mijn kind veel enthousiaster is over school! Elke ouder wilt graag dat zijn kind het goed doet op school, en Study Smart draagt daar aan bij.
Dankzij StudySmart heb ik vorig jaar al mn examens gehaald en ook veel betere punten gehaald. Maar bovenal heb ik nu gewoon een heel goede studiemethode onder de knie, waarmee ik zeker weet dat ik de rest van mijn studie gewoon ga halen.
Hoe verloopt peptide fragmentatie in een collision cell?
- a/x
- b/y
- c/z
- Ion type a, b of c zijn een geladen N-terminus fragment.
- Ion type x, y of z zijn een geladen C terminus fragment.
- c- en y-ionen abstraheren een extra proton van het voorloperpeptide
- Afhankelijk van de fragmentatietechniek kunnen verschillende ionen worden gevormd
Hoe werkt peptide karakterisering?
- Aminozuursequenties worden gekenmerkt door MS/MS
- Peptidefragmenten worden waargenomen in het MS/MS-spectrum
- Verschillen in intensiteiten van de pieken zijn afhankelijk van de efficiëntie van fragmentatie/ionisatie
- Door te kijken naar de combinaties kunnen de verschillen in massa's tussen de b en y worden voorspeld en op die manier een schatting doen van de sequentie
Hoe kom je achter de sequentie van een peptide?
Hoe kan je leucine en isoleucine van elkaar onderscheiden in een Mass Spectrum?
- Als je vantevoren weet naar welk eiwit je opzoek bent dan kan je uit de database halen of het om een isoleucine gaat, doordat de buur-aminozuren dat verklappen.
Wat is een speciale situatie bij de novo peptide sequencing?
Extra gewicht is 19 Da!
Hoe kom je van het sequencen van peptiden tot een identificatie van het eiwit?
- Identificatie van ionen
- Mapping met meerdere peptiden afgeleid van een enkel eiwit
- Uitgebreide zoekacties in databases vereist
- Hogere resolutie/massanauwkeurigheid > betere specificiteit
Effect van massanauwkeurigheid en massatolerantie op peptide massa fingerprinting resultaten. Meer overeenkomende m/z-waarden = meer nauwkeurigheid = minder hits mogelijkheden (specifieker)
Resolutie en aantal verschillende peptiden is belangrijk.
Wat is het overzicht van de proteomic workflow (stroomschema)?
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
