Startpagina / Samenvattingen / Essential Cell Biology, Fourth Edition / rna-dna-transcriptie

DNA tot eiwit: Hoe de cel leest de genoom

Q: Bij transcriptie van EU DNA welke delen worden door gegeven?

EU gen in DNA bestaat uit intronnen en exonnen , beide wordt transcribbed

Q: Wat gebeurt met de RNA strand na de capping?

RNAP - transcribeerd gen -> Splicing -> (intron verwijderd) exonen samen gestikt.-> Poly A -> ( gemodificeerd 5'-3') functioneel mRNA Splicing door snRNP's (die bindt een eiwit ervoor) - makt het kern ervan

40 belangrijke vragen over DNA tot eiwit: Hoe de cel leest de genoom

Wie zet transcriptie in gang?

RNA-polymerase

Benoem structurele verschillen van RNA met DNA?

Enkelsteng - vorm -> functie -> katalyse

Welke enzym zorgt voor de RNA transcriptie?

RNA -polymerase:

katalyse fosfodiester bondings
Vorming suikerfosfaat backbone

Wat maakt RNA-polymerase op de DNA strand om te stoppen?

Volgorde van nucleotiden.
Aan de promotor zit een volgorde die wijst voor het starten
Voor bacterieen is Sigma-factor

Ongeacht gleijkenis RNAP en DNAP, wat zijn verschillen?

RNAP - katalyseerd ribonucleotiden, geen deoxyribonucleotiden
RNAP - anders dan DNAP geen primer nodig voor streng te starten.

Fouten zijn togestaan dus RNA is geen opslagruimte GI

Welke tippen RNA zijn bekend?

mRNA- instructie dragers
rRNA - componenten van ribosomen
tRNA - Adapter tijdens eiwit synthese

Wat is het verschil tussen PK en EU in transcriptie?

PK - DNA in cytosplasm met ribosomen waar eiwit synthese gebeurt
EU - DNA in de kernen (transcriptie) maar eiwit in de ribosomen die in cytoplasma staan ->steps van maken verschillende RNA

Wat wordt gemaakt door "capping and polyadenylation"

mRNA

Hoger stabiliteit
Eiwit herkent een complete boodschaap

Bij transcriptie van EU DNA welke delen worden door gegeven?

EU gen in DNA bestaat uit intronnen en exonnen, beide wordt transcribbed

Wat gebeurt met de RNA strand na de capping?

RNAP - transcribeerd gen -> Splicing -> (intron verwijderd) exonen samen gestikt.->Poly A -> (gemodificeerd 5'-3') functioneel mRNA Splicing door snRNP's (die bindt een eiwit ervoor) - makt het kern ervan

DNA codering alfabet?

Een volgorde van 4 nucleotiden 1950

Hoe wordt informatie van DNA doorgegeven?

Eerst van DNA naar een ander nucleïnezuur RNA. Gen uit DNA segment bepaald hoe een eiwit moet gesynthetiseerd worden.

Wat is samen met transcriptie en translatie?

Manier waarop cellen worden gelezen en expressen de instructies uit gennen

Wat is de eerste proces van expressie?

Dit is kopiëren van de gen nucleotiden volgorde op RNA - transcriptie

Wat zijn verschillen van transcriptie uit DNA replicatie?

RNA streng - blijft niet waterstof gebonden ipv blijft achter de toegevoegde ribonucleotiden
RNA verplaatst, DNA hervormt. Daarom RNA is enkel streng
RNA kopieert -> korter enkel duizend NP tv DNA 250 miljoen

Wat is de gen expressie?

Een proces waarbij de informatie gecodeerd in DNA is vertaald in een product dat invloed heeft aan de cel of organisme

Als eind product een eiwit is, omvat GE transcriptie en translatie (vertaling)
Als een RNA is eind product van een gen, hoeft er geen translatie plaats te vinden

Wat is de rol van bepaalde RNA?

mRNA - codeert voor eiwitten
rRNA - Maakt de kern van ribosom structure, katalyseerd eiwit synthese
miRNA - Regulatie van genexpressie
tRNA - adoptoren tussen mRNA en aminozuren (eiwit synthese)
De rest

Wat gebeurt als RNAP botst met DNA?

Bacteriën - herkenningsplaats wordt bepaald "promotor" - direct stroom op specifieke volgorde van NC
Gevonden ->gebonden ->openen->Klein stukjes DNA
Een DNA is template BP wit complientair BP trifosftaen
Twee ervan TF gebonden RNAP om te syntheseren
Streng verlengen totdat stopcodon komt

Welke streng is template?

Kijk naar onderstreept, wegens polariteit van promotor kan alleen 3->5 richting gekozen worden (in gegeven voorbeeld)

DE ORIENTATIE VAN PROMOTOR bepaald welke richting moet en welke streng template moet zijn

Wat zijn verschillen in de RNAP en initiatie transcriptie factoor PK en EU?

EU :
- RNAP I - transcribeerd tRNA, rRNA ander (katalyse etc)
- RNAP II - miRNA
- RNAP III - tanscribeerd tRNA, rRNA ander (katalyse etc)
- Bacteriën hebben iv en v nog
- Met Sigma factor alles kan zelf doen EU de hele machinerie hoef hebben
PK:
Initiatie transcriptie factor complex, groot afstnd tussen NP voor EU, kleine voor PK
EU compact verpakking DNA (nucleosoom)

Wat is noodzakelijke voor RNAP om te starten?

TATA box hebt nodig TFIID = TFB te binden
TFIID laat TFIIB te binden
De rest met de RNAP bindt aan promotor
TFIIH aandeel dubbel helix uit elkaar op start punt (ATP)
TFIIH ook fosforyleert RNAP vrij maken uit TF
De kant van fosforylatie is lange polypeptide keten staart streekt uit RNAP

Wat maakt transcriptie initiatie complex?

TBP is subunit uit TFIID bindt dat treekt andere TF dat ales vormt TIC

Hoe en met wat wordt RNAP vrijgemaakt?

TFIIH dat een PROTEIN KINASE hebt
Als transcriptie begon, wordt alle TF vrij (niet meer nodig)
Als RNAP is klaar met transcriptie van een gen, heeft het fostfaat groep op zijn start die met fosfatase wordt verwijdeert

Is de eiwit synthese hetzelfde in bacterie en EU?

Nee, DNA templating wel om RNA te maken wel maar eiwit niet
Bacteriel direct naar de cytoplasma ->ribosomen->aan de 5' eind
EU->mRNA->capping, splicing, polyadenilatiie->cytosol deze processen gebeurt meteen na de afsnijden van gefosforyleerd staart tijden RNA synthese uit RNAP

Wanneer gebeurt capping en polyadenilatie?

Als de eind product mRNA is

Hoe gebeurt capping en polyadenilatie?

Capping - Na de maken van 25 NC door RNAP voor het eind transcriptie wordt G gemetyleerd aan 5'
Polyadenylatie - Specifieke 3' waardoor:

PK - RNA transcriptie beendigt
EU - Een enzym verwijdert op een bijzonder volgorde

- Tweede enzym bindt poly-A start (circa 100 NC)

Wat zijn intronen en exonen, waar bevinden ze zich?

Intronen - noncodering geddelte alleen EU
exonen - codering volgorde NC - expressed volgorde

Aan het eind van intronen staat klein stukjes exonen die worden verwijderd in vorm van lasso

Wat is bijzonder met splicing vm andere stappen?

Splicing gebeurt afzonderlijk door RNA en niet door de eiwitten (snRNA)

De snRNA maakt deel van kern van SPLICOSOMEN

Splicing vergroot codering potentiaal van menselijke genoom
Niewue eiwiten wordt gecreeert door mixing en matching exons
U1....zijn snRNP's ->U1-5', U2-3" ->Compl.BP- >eiwit interactie
Omlegging BP snRNP's en RNA transcript leidt splicosome exons te vinden en snijden

Hoe en wat zorgt voor een correcte transport uit pre-mRNA en mess om naar cytosol rijpe mRNA te transporteren?

Kern poriën
poriën maakt verbinding met nucleoplasm uit cytosol en selectief transporteert.
Set van eiwitten bepalen, poly-A gebondend EW, cap-binding complex en mRNA gebondend EWeen deel wordt getransporteerd, hergebruikt (NC), verwijderd

Wat gebeurt met mRNA's in de cytosol?

EU - 30min - 10 uur gedrageerd door ribonucleases in NC
Bacteriele - 3 min
Respons aan het signaal bepaalend, verzorgt door ribonucleases, gebeurt in 3' niet-vertallde regio van RNA (tussen 3' en poly-A) - control over EW secretie

Hoe komt introns in EU maar niet in PK?

Hetzelfde voorouder van polymerase, verschillende RNA splicing ; zijn er twee beweringen:

Een gen meerdere EW, door exon m-m nieuwe gennen evolueren -> grotere genoom , grotere RNA functie. PK - door evolutie sneller te vermenigvuldigingen hebben verliest
Door mobiele parasiet genetisch elementen de EU DNA binnengevallen.

Door wijze van wat DNA->RNA->aminozuur volgorde in een eiwit wordt doorgegeven?

Nucelotide volgorde in aminozuur volgorde door genetische code. (Behalve mitochondira eigen)
Een mRNA heeft 3 NC codon,
Rischting van codons zijn met 5' naar de links?
1961 = 4x4x4 = 64 mogelijk combinaties

Hoe werd genetische code gevonden?

Door de cracken van mRNA peptideketen mede scheiding in centrifuge
Wederopbouw door ribonuclease en fosforylase
Gebruik van poly-U(F), poly-A(K), ploy-C (P) keten
Volgende stap poly start te gebruiken
Uiteindelijk uitvinding dat drie NC lengte was (dus ribosoom en tRNA ook moet specifiek zijn )

Leg uit de werking en structuur van tRNA?

Een set van kleine RNA moleculen - transfer RNA's bindt mRNA met AZ
Kan verschillend zijn de grote (80 NC lang) en matching.
3D vorm, kan terug ontvouwen tot dubbel helix te vormen
Een regio vormt geen H-bonds- crucial voor functie
De anticodon regio bindt mRNA
Aan de 3' bindt AZ
Een rRNA kan match meerdere AZ

Hoe wordt tRNA bindt aan AZ?

Met synthsasen - zijn 20 in total.

Dit enzym katalyseerd de reactie dat AZ gebonden aan 3' tRNA, cellen gebruik van maken voor energie gekoppeld hydrolysis ATP
Geladen AZ wordt gebonden, energie rijke bond wordt gemaakt.

Wat is het verschil tussen ribsoom en ribozym?

RS - meest complex 2/3 RNA 1/3 EW (mass) rRNA zijn verantwoordelijk voor zijn structuur
RS - compact, 3D, op de operavlakte staan te vullen gevouwen RNA's
RS fucntie is te vouwen en vorm creëren voor RNA
23S rRNA - kant spelt katalytisch functie voor PP keten - peptedyl transfrase - dit heet ribozyme

Hoe wordt EW synthese begint EU?

Vertalen van mRNA op codon AUG . geladen tRNA (altijd methionine, formyl-methionine bacteria) op N-terminus dus eind ew synthese eerst
Methionine verwijderd door protease
EU - wordt aan de P site van ribosoom waar intiatie-transcriptie factoren zetten (eiwitten).
RS zoekt AUG 5'-3' , gevonden AUG dissociatie TF, volgende additie via tRNA aan A.
EU dragt signaal voor de particulaire ew

Hoe wordt EW synthese begint PK?

Geen 5' cap ipv ribosoom-binding volgorde (tot 6 NC) boven AUG
RS - bindt in de binnenste mRNA - polycistronic (encode voor meerdere EW)
Stop codons UAA, UAG, UGA tRNA herkent niet - signal aan RS om te stoppen
Eiwit (release factor) bindt aan codon die in A kant zit dit geeft peptidyl transferase om water te produceren
OH is vrijgemaakt - > mRNA gedissocieerd
Nieuwe EW ontmoetten chaperons.

Benoem post translationale modificatie van EW verder uit ribosomen?

Fosfolyratie - een manier, er zijn meerdere maar het meest belangrijke is initiatie van transcriptie tijdens gen expressie

Welk van DNA, RNA of EW kan originele molecuul bouwen?

RNA

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

Essential Cell Biology, Fourth Edition | 9781317806271 | Bruce Alberts, et al

Bekijk samenvatting

Een unieke studie- en oefentool
Nooit meer iets twee keer studeren
Haal de cijfers waar je op hoopt
100% zeker alles onthouden

Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.