Welke raad je aan om te kiezen
3 belangrijke vragen over Welke raad je aan om te kiezen
Een arts-onderzoeker heeft een tumor gevonden in de lever van een darmkankerpatient. Het is onduidelijk of deze tumor is ontstaan in de lever of dat het een uitzaaiing is van de darmkanker. Er wordt RNA sequencing uitgevoerd op de tumor in de lever, de gezonde darm, en de gezonde lever.
De onderzoeksvraag is: lijkt de tumor in de lever meer op leverweefsel of meer op darmweefsel?
Heatmap, zo kan je genen met elkaar vergelijken. Je ziet zo vergelijkbare genen op een plek. Je kan de genen die geclusterd voor komen met elkaar vergelijken. Je kan meerder condities met elkaar vergelijken.
Er zijn 5 patiënten met uitgezaaide melanoom (huidkanker) en 5 patiënten met een melanoom die niet is uitgezaaid. Er is RNA sequencing gedaan op de tumoren van deze 10 patiënten.
De onderzoeksvraag is: Welke genen komen het meest tot overexpressie bij patiënten met uitgezaaide melanoom?
Volcano, want zo kan je zien welke genen meer of meerder actief zijn. (heatmap zou ook kunnen)
Bij patiënten met de auto-immuunziekte Lupus zie je vaak dat de macrofagen actief worden. Het is nog niet duidelijk hoe deze macrofagen bijdragen aan het verloop van de ziekte. Er is RNA-seq data beschikbaar van macrofagen van Lupuspatiënten en gezonde controles.
De onderzoeksvraag is: Brengen macrofagen in Lupuspatiënten genen tot overexpressie die betrokken zijn bij ontsteking?
GSEA, wat je weer wat het veroorzaakt maar je wil de genen weten zodat je kan uitzoeken waar de fout zit.
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
