Startpagina / Samenvattingen / Class notes - Genoom / translatie-eiwitten-mrnas

E-modules en boek - post-transcriptional control

Q: Verschillende mechanismen voor deze RNA lokalisatie zijn en op welke plek zit dit signaal.

Het signaal voor deze lokalisatie zit meestal in de 3’UTR . Directed transport : mRNA-moleculen binden aan motoreiwitten die de mRNA-moleculen over het cytoskelet naar een specifieke plek transporteren, waar ze vervolgens vastgehouden worden door ‘anker-eiwitten’. Random diffusion and trapping : op een specifieke plek in de cel bevinden zich ‘ankereiwitten’ die specifieke mRNA-moleculen vasthouden. Local protection by trapping : de mRNA’s worden overal in de cel snel afgebroken, behalve op de plek waar zich ankereiwitten bevinden. Deze eiwitten binden de mRNA’s, waardoor ze beschermd zijn tegen afbraak.

Q: verschillende mechanismen van controle van translatie gegeven (voorbeelden komen uit bacteriën) (4):

Eiwitten binden aan sequenties in het mRNA om translatie te onderdrukken door bijvoorbeeld de Shine-Dalgarno sequentie te bedekken. Temperatuur heeft invloed op interne baseparing in het mRNA en daarmee op de bereikbaarheid van een AUG. Binding van een klein molecuul aan een riboswitch . Basenparing van ‘antisense’ RNA aan het mRNA blokkeert translatie.

Q: Regulatie van mRNA stabiliteit zijn P-bodies en stress granules bij betrokken, wat doen p-bodies en stress granules?

mRNAs die niet meer nodig zijn, worden naar de P-bodies verplaatst. mRNAs die al gedeeltelijke afbraak door poly-A shortening hebben ondergaan, worden in de P-bodies verder afgebroken door RNA-afbrekende enzymen. Sommige RNAs die nog intact zijn, kunnen in de P-bodies bewaard worden tot ze weer nodig zijn in de cel. (mRNA degradatie). Als de cel in een stresssituatie belandt, kan de translatie tijdelijk stilgelegd worden. De mRNAs worden dan tijdelijk opgeslagen in stress-granules . Als de stresssituatie voorbij is, komen de mRNAs weer vrij in het cytoplasma voor translatie. (mRNA storage).

7 belangrijke vragen over E-modules en boek - post-transcriptional control

Wat zijn post-transcriptionele controles?

post transcriptonale conrtol is actief na dat RNA-polymerase heeft gebonden aan de promotor en RNA synthese is begonnen.
Post-transcriptionele controles vinden plaats nadat de transcriptie gestart is. Post-transcriptionele controles zijn essentieel voor de controle van vele genen.

Gereguleerde nuclear transport?

Er zijn mechanismen die er voor kunnen zorgen dat unspliced RNA toch de kern uit wordt getransporteerd. Bepaalde eiwitten binden dan aan het per-mRNA zodat het wel de cel uit kan.

Verschillende mechanismen voor deze RNA lokalisatie zijn en op welke plek zit dit signaal.

Het signaal voor deze lokalisatie zit meestal in de 3’UTR.

Directed transport: mRNA-moleculen binden aan motoreiwitten die de mRNA-moleculen over het cytoskelet naar een specifieke plek transporteren, waar ze vervolgens vastgehouden worden door ‘anker-eiwitten’.
Random diffusion and trapping: op een specifieke plek in de cel bevinden zich ‘ankereiwitten’ die specifieke mRNA-moleculen vasthouden.
Local protection by trapping: de mRNA’s worden overal in de cel snel afgebroken, behalve op de plek waar zich ankereiwitten bevinden. Deze eiwitten binden de mRNA’s, waardoor ze beschermd zijn tegen afbraak.

verschillende mechanismen van controle van translatie gegeven (voorbeelden komen uit bacteriën) (4):

Eiwitten binden aan sequenties in het mRNA om translatie te onderdrukken door bijvoorbeeld de Shine-Dalgarno sequentie te bedekken.
Temperatuur heeft invloed op interne baseparing in het mRNA en daarmee op de bereikbaarheid van een AUG.
Binding van een klein molecuul aan een riboswitch.
Basenparing van ‘antisense’ RNA aan het mRNA blokkeert translatie.

Wat zijn en doen internal ribosome entry sites (IRES)?

Internal Ribosomal Entry Sites zijn mRNA-sequenties die in bepaalde 3D structuren kunnen vouwen waaraan translatie-initiatie eiwitten kunnen binden. Initiatie van translatie bij IRES heeft dus geen 5'cap nodig. Hierdoor kan een ander gen wat op hetzelfde mRNA ligt ook worden getransleerd, ook al heeft deze niet de eerste AUG. IRES-afhankelijke translatie-initiatie komt vooral voor bij virussen.

Twee mechanismen voor de afbraak van mRNA in eukaryoten?

Eiwitten kunnen aan de 3'UTR binden en invloed uitoefenen op de snelheid van poly-A shortening, decapping en 3'-5' afbraak.
Sommige mRNA’s worden afgebroken doordat ze gekliefd worden door specifieke endonucleases die een sequentie in de 3'UTR herkennen. Andere eiwitten kunnen aan deze sequenties binden en zo afbraak voorkomen.

Regulatie van mRNA stabiliteit zijn P-bodies en stress granules bij betrokken, wat doen p-bodies en stress granules?

mRNAs die niet meer nodig zijn, worden naar de P-bodies verplaatst. mRNAs die al gedeeltelijke afbraak door poly-A shortening hebben ondergaan, worden in de P-bodies verder afgebroken door RNA-afbrekende enzymen. Sommige RNAs die nog intact zijn, kunnen in de P-bodies bewaard worden tot ze weer nodig zijn in de cel. (mRNA degradatie).

Als de cel in een stresssituatie belandt, kan de translatie tijdelijk stilgelegd worden. De mRNAs worden dan tijdelijk opgeslagen in stress-granules. Als de stresssituatie voorbij is, komen de mRNAs weer vrij in het cytoplasma voor translatie. (mRNA storage).

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

Genoom

Bekijk samenvatting

Een unieke studie- en oefentool
Nooit meer iets twee keer studeren
Haal de cijfers waar je op hoopt
100% zeker alles onthouden

Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.

Onderwerpen die gerelateerd zijn aan E-modules en boek - post-transcriptional control

E-modules en boek - post-transcriptional control - regulatie van genexpressie bij noncoding RNA's

Studiemateriaal generieke omslagafbeelding

E-modules en boek - post-transcriptional control

7 belangrijke vragen over E-modules en boek - post-transcriptional control

Wat zijn post-transcriptionele controles?

Gereguleerde nuclear transport?

Verschillende mechanismen voor deze RNA lokalisatie zijn en op welke plek zit dit signaal.

verschillende mechanismen van controle van translatie gegeven (voorbeelden komen uit bacteriën) (4):

Wat zijn en doen internal ribosome entry sites (IRES)?

Twee mechanismen voor de afbraak van mRNA in eukaryoten?

Regulatie van mRNA stabiliteit zijn P-bodies en stress granules bij betrokken, wat doen p-bodies en stress granules?

Onderwerpen die gerelateerd zijn aan E-modules en boek - post-transcriptional control

E-modules en boek - post-transcriptional control - regulatie van genexpressie bij noncoding RNA's

Samenvattingen die gerelateerd zijn aan Mijn lesaantekeningen - eiwitinteracties en DNA-interacties

Class notes - Genoom

Human Physiology An Integrated Approach, Glo…

Statistiek

Organische Chemie

MBOC

Orgaansystemen

Weefsels

Fysische chemie

MMK

Human monogenetic diseases

genoom deel 2

eiwitten en moleculen