Proteomics, metabolomics, miRNA's en RNAi screens

9 belangrijke vragen over Proteomics, metabolomics, miRNA's en RNAi screens

Welke soort analyse mogelijkheden zijn er om de mate van genexpressie door het bestuderen van Proteomics in kaart te brengen?

  1. Eiwit-identificatie
  2. Eiwitmodificatie
  3. Identificeren van eiwit-interacties


alle 3 kan in kaart worden gebracht dmv massaspectrometrie

Hoe gaat eiwit identificatie?

  • In stukjes laten knippen door trypsine digestie
  • --> massaspectrometie
  • Data vergelijking
  • ID van eiwit

Hoe gaat de identificatie van eiwit-interacties?

Er kan gekeken worden naar welke eiwitten binden met het eiwit van interesse

  • antilichaam voor eiwit van interesse toevoegen aan mengsel met eiwitten
  • --> eiwit van interesse gaat binden
  • --> andere eiwitten worden weggewassen
  • --> mbv massaspectrografie worden eiwitten in kaart gebracht --> eiwit interacties opgehelderd

  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Hoe gaat de identificatie van eiwitmodificaties?

  • Trypsine toevoegen in eiwitmengsel
  • verrijking fosfopetiden
  • massaspectrometrie
  • door moleculaire massa kan achterhaald worden welke peptiden gefosforyleerd zijn

Waarom is mRNA niet altijd voorspellend voor eiwit(activiteit)?

mRNA zorgt niet alleen voor eiwitactiviteit, maar ook voor;
  • Regulatie van eiwitmodificaties (fosforylering etc)
  • Regulatie van eiwit stabiliteit
  • Regulatie van translatie
    • aantal eiwitten dat van een mRNA molecuul gemaakt wordt
    • --> op het niveau van microRNA's

Hoe wordt de translatie gereguleerd?

MicroRNA's hebben een regulerende functie voor het transgeen van mRNA - bepalen hoeveel eiwitten er van een mRNA wordt gemaakt;



  • Van het DNA wordt een stuk RNA afgeschreven; pre-miRNA
  • Drohsa (enzymcomplex)knipt het tot miRNA
  • transport naar cytoplasma
  • Dicer knipt het complex tot miRNA
  • 1 streng wordt in gebouw in het RISC-complex
    • In dit complex kan het weer binden aan een complementaire sequentie in jet mRNA

-->
  • miRNA zorgt voor specificiteit
  • eiwitcomponenten zorgen voor repressie van translatie of voor mRNA afbraak

Wat is het belang van microRNA voor kanker?

  • miRNA-16 verlaagd
  • --> apoptose remming en celcyclus progressie

Hoe kan ingegrepen worden om de groei van kankercellen te remmen?

  • Men kan proberen om eiwitproduct weg te vangen - remmen van kinase activiteit van BCR-ABL
    • --> nadeel:
      • probleem met specificiteit remmer
      • Gemakkelijk resistentie ontstaan
  • Men kan ook mRNA af laten breken door siRNA

Hoe werkt RNA interferentie? Wat zijn nadelen/voordelen als behandeling voor kanker?

  • RNAi - mRNA afbreken door siRNA
    • --> voorkomt dat eiwitten die essentieel zijn voor groei van cel tot expressie komen


Voordelen
  • Het is eenvoudig toe te passen op elk willekeurig gen waar men de sequentie van weet --> specifiek
  • Is ook zeer geschikt voor hoge doorvoer analyse
Nadelen
  • Men weet nog niet hoe het siRNA in de gewenste cellen ingebracht moet worden.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo