Proteomics, metabolomics, miRNA's en RNAi screens
9 belangrijke vragen over Proteomics, metabolomics, miRNA's en RNAi screens
Welke soort analyse mogelijkheden zijn er om de mate van genexpressie door het bestuderen van Proteomics in kaart te brengen?
- Eiwit-identificatie
- Eiwitmodificatie
- Identificeren van eiwit-interacties
alle 3 kan in kaart worden gebracht dmv massaspectrometrie
Hoe gaat eiwit identificatie?
- In stukjes laten knippen door trypsine digestie
- --> massaspectrometie
- Data vergelij
king
- ID van eiwit
Hoe gaat de identificatie van eiwit-interacties?
- antilichaam voor eiwit van interesse toevoegen aan mengsel met eiwitten
- --> eiwit van interesse gaat binden
- --> andere eiwitten worden weggewassen
- --> mbv massaspectrografie worden eiwitten in kaart gebracht --> eiwit interacties opgehelderd
- Hogere cijfers + sneller leren
- Niets twee keer studeren
- 100% zeker alles onthouden
Hoe gaat de identificatie van eiwitmodificaties?
- Trypsine toevoegen in eiwitmengsel
- verrijking fosfopetiden
- massaspectrometrie
- door moleculaire massa kan achterhaald worden welke peptiden gefosforyleerd zijn
Waarom is mRNA niet altijd voorspellend voor eiwit(activiteit)?
- Regulatie van eiwitmodificaties (fosforylering etc)
- Regulatie van eiwit stabiliteit
- Regulatie van translatie
- aantal eiwitten dat van een mRNA molecuul gemaakt wordt
- --> op het niveau van microRNA's
Hoe wordt de translatie gereguleerd?
- Van het DNA wordt een stuk RNA afgeschreven; pre-miRNA
- Drohsa (enzymcomplex)knipt het tot miRNA
- transport naar cytoplasma
- Dicer knipt het complex tot miRNA
- 1 streng wordt in gebouw in het RISC-complex
- In dit complex kan het weer binden aan een complementaire sequentie in jet mRNA
-->
- miRNA zorgt voor specificiteit
- eiwitcomponenten zorgen voor repressie van translatie of voor mRNA afbraak
Wat is het belang van microRNA voor kanker?
- miRNA-16 verlaagd
- --> apoptose remming en cel
cyclus progressie
Hoe kan ingegrepen worden om de groei van kankercellen te remmen?
- Men kan proberen om eiwitproduct weg te vangen - remmen van kinase activiteit van BCR-ABL
- --> nadeel:
- probleem met specificiteit remmer
- Gemakkelijk resistentie ontstaan
- Men kan ook mRNA af laten breken door siRNA
Hoe werkt RNA interferentie? Wat zijn nadelen/voordelen als behandeling voor kanker?
- RNAi - mRNA afbreken door siRNA
- --> voorkomt dat eiwitten die essentieel zijn voor groei van cel tot expressie komen
Voordelen
- Het is eenvoudig toe te passen op elk willekeurig gen waar men de sequentie van weet --> specifiek
- Is ook zeer geschikt voor hoge doorvoer analyse
- Men weet nog niet hoe het siRNA in de gewenste cellen ingebracht moet worden.
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
![Trustpilot-logo](/images/design_2020/lp/clp-trustpilot-nl.png)