Startpagina / Samenvattingen / Histologie en genetica / cgh-hybridization-comparative

Klinische cytogenetica - Cytogenetische technologie en nomenclatuur - CGH

4 belangrijke vragen over Klinische cytogenetica - Cytogenetische technologie en nomenclatuur - CGH

Waarvoor wordt comparative genomic hybridization (CGH) gebruikt?

Verliezen of duplicaties van hele chromosomen of specifieke chromosoomgebieden kunnen worden gedetecteerd met een veelgebruikte techniek die bekend staat als comparative genomic hybridization (CGH).

Hoe werkt comparative genomic hybridization (CGH)?

1) DNA isoleren
2) test-DNA (rood) en controle-DNA (groen) kleur geven die zichtbaar is onder fluorescente microscoop
3) DNA hybridiseren met normale metafase-chromosomen

Als een chromosoomgebied in de tumorcel wordt gedupliceerd, zal het overeenkomstige gebied van het metafasechromosoom hybridiseren met overtollige hoeveelheden roodgelabeld DNA. Dit gebied zal onder de microscoop rood lijken.
Omgekeerd, als een gebied in de tumorcel wordt verwijderd, zal het overeenkomstige gebied van het metafasechromosoom alleen hybridiseren met groen gelabeld controle-DNA, en zal het gebied er onder de microscoop groen uitzien.

Wat is een nadeel van comparative genomic hybridization (CGH)?

Een beperking van CGH bij gebruik met metafasechromosomen is dat deleties of duplicaties kleiner dan 5 tot 10 Mb niet microscopisch kunnen worden gedetecteerd. Een techniek die een hogere resolutie biedt is de array comparative genomic hybridization (aCGH).

Hoe werkt array comparative genomic hybridization?

Hierbij wordt het test- en controle-DNA gehybridiseerd met een micoarray die vele oligonucleotideprobes bevat. Deze microarrays bieden een resolutie van 50 tot 100 kb of zelfs minder, waardoor duplicaties en deleties (copy number variants = CNV) kunnen worden gedetecteerd die mogelijk slechts één enkel gen beïnvloeden.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

Histologie en genetica

Bekijk samenvatting