Systematiek classificatie
8 belangrijke vragen over Systematiek classificatie
Gewortelde vs ongewortelde fylogenetische boom
Ingroup vs Outgroup in fylogenetische boom
Outgroup (los van de voorouder voordat andere groepen van elkaar afstammen, primitieve staat)
Wortel, branch, node, taxon, clade fylogenetische boom
-branch is de tak van de fylogenetische boom
-node is afsplitsing in de fylogenetische boom (kunnen draaien = zelfde resultaat)
-taxon is groep organismen die dicht gerelateerd zijn
-clade is de tak van groep organismen die bestaat uit afstammelingen en de gemeenschappelijke voorouder
- Hogere cijfers + sneller leren
- Niets twee keer studeren
- 100% zeker alles onthouden
Monofyletisch, parafyletisch, polyfyletisch
Parafyletisch: voorouder + sommige afstammelingen (bv reptielen
Polyfyletisch: zonder voorouder
Synapomorfie, autopomorfie, syneplesiomorfie,homoplasie
Autapomorfie = afgeleid kenmerk in een enkel taxon
Synplesiomorfie = gedeeld primitief kenmerk
Homoplasie = kenmerktoestand die meerdere keren onafhankelijk is geëvolueerd.
3 methoden bij het maken van een fylogenetische boom
-UPGMA
-moleculaire klok
UPGMA = Unweighted Pair Group Method using Arithmetic means (4 stappen)
2. Identificeer de twee meest gerelateerde taxa
3. Bereken de afstanden opnieuw met deze twee samengevoegd als 1 taxon
4. Herhaal tot alle afstanden berekend zijn
UPGMA is snel, heeft een simpel algoritme, maar de aanname dat mutatiesnelheden constant zijn is incorrect en er wordt 1 boom berekend, geen alternatief.
Moleculaire klok om fylogenetische boom te maken
Maar DNA kan in mutatiesnelheid verschillen! Van langzaam naar snel
(* 10-10 10-4): genen die betrokken zijn in essentiële celfuncties – genen die betrokken zijn in fysiologische processen – non-coding DNA – genen die betrokken zijn in het immuunsysteem
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden