Systematiek classificatie

8 belangrijke vragen over Systematiek classificatie

Gewortelde vs ongewortelde fylogenetische boom

Met/zonder kennis of aannames over de richting

Ingroup vs Outgroup in fylogenetische boom

Ingroup: groep organismen die dichter gerelateerd zijn dan de outgroup
Outgroup (los van de voorouder voordat andere groepen van elkaar afstammen, primitieve staat)

Wortel, branch, node, taxon, clade fylogenetische boom

-wortel is laagste punt van de fylogenetische boom
-branch is de tak van de fylogenetische boom
-node is afsplitsing in de fylogenetische boom (kunnen draaien = zelfde resultaat)
-taxon is groep organismen die dicht gerelateerd zijn
-clade is de tak van groep organismen die bestaat uit afstammelingen en de gemeenschappelijke voorouder
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Monofyletisch, parafyletisch, polyfyletisch

Monofyletisch: voorouder + alle afstammelingen
Parafyletisch: voorouder + sommige afstammelingen (bv reptielen
Polyfyletisch: zonder voorouder

Synapomorfie, autopomorfie, syneplesiomorfie,homoplasie

Synapomorfie = verworven gedeelde eigenschappen
Autapomorfie = afgeleid kenmerk in een enkel taxon
Synplesiomorfie = gedeeld primitief kenmerk
Homoplasie = kenmerktoestand die meerdere keren onafhankelijk is geëvolueerd.

3 methoden bij het maken van een fylogenetische boom

-maximale parsimonie
-UPGMA
-moleculaire klok

UPGMA = Unweighted Pair Group Method using Arithmetic means (4 stappen)

1. Variabele kenmerken worden samengevat in een matrix die genetische afstanden tussen taxa bevat, mbv nucleotide sequence verschillen
2. Identificeer de twee meest gerelateerde taxa
3. Bereken de afstanden opnieuw met deze twee samengevoegd als 1 taxon
4. Herhaal tot alle afstanden berekend zijn
UPGMA is snel, heeft een simpel algoritme, maar de aanname dat mutatiesnelheden constant zijn is incorrect en er wordt 1 boom berekend, geen alternatief.

Moleculaire klok om fylogenetische boom te maken

Moleculaire klok is een methode waarmee verschillen in het DNA van twee of meer soorten gebruikt wordt om te schatten hoe lang geleden die soorten een gemeenschappelijke voorouder hadden.
Maar DNA kan in mutatiesnelheid verschillen! Van langzaam naar snel
(* 10-10  10-4): genen die betrokken zijn in essentiële celfuncties – genen die betrokken zijn in fysiologische processen – non-coding DNA – genen die betrokken zijn in het immuunsysteem

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo