Evolutionary profiles

9 belangrijke vragen over Evolutionary profiles

Welke vier verschillende puntmutaties zijn er?

1. Synonymous mutation.
Er hierbij veranderd er een nucelodien maar het zorgt niet voor een verandering in de aminozuur.


2. Non-synonmous  mutation
Dna mutaties die wel leidt tot verandering in het aminozuur.

3. Missense mutation
Een AA is replaced bij een andere AA

4. Nonsense mutatoin.
AA replaced bij een stop codon.

Beantwoord de vraag. Wat kan er geleerd worden aan de hand van alignment in de afbeelding?

Je kan bekijken welke delen belangrijk zijn. Als je kijkt naar de relatie tussen de wee proteins dan leer je dat ze related zijn. Ze zijn niet erg vergelijkbaar. Het antwoord is dus A. De functie en structuur dat is lastiger omdat het ook afhankelijk is van hoe ze gevouwen zijn.

Beantwoord de vragen over de weergegeven sequences van DNA. Hoeveel komen ze overeen en welke dingen worden gebruikt om daar achter te komen?

Je kijkt naar de matched, mismatched en penalty/gaps en op basis daarvan kijk je naar wat de alignement score is.

In dit geval: Matches: 4, mismatches: 1 en gaps:1

Penalty is 2 dus per gaps dan gaan er twee vanaf.

Aan de hand van de formule met de sommatie komt uit:

4-1 -2 = 1.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Vul deze alignement in en geef aan wat de optimal alignement score is.

Alignement is de meest rechter cel. In dit geval 2.

Wat is multiple sequence alignment?

Hierbij heb je meerdere sequences die je vergelijkt met 1 bepaalde sequence. Hierbij heb je meerdere sequences en kan je echt kijken welke delen conserved zijn en welke niet.

Waarom is het handig om naar structuur verschil in aminozuren te kijken voor de homology?

Een leucine zal makkelijker veranderen in een isoleucine dit komt omdat ze niet veel van elkaar verschil Een luicine en een lysine daarin tegen verschillen veel van elkaar en zullen dus niet snel veranderen. Je kan dus bekijken hoe groot de kans is dat deze verandering plaatsvindt. Je kijkt naar hoevaak het concerten is en dan bepaal je de probability. Dit is afhankelijk van hoeveel aminozuren er zijn qi en qj zijn dan.

Wat geeft een blossom 62 weer?

Dit geeft de kans weer dat een bepaald nucleotiden veranderd in een andere. Positief komt het vaak voor en negatief niet zo vaak. Ze geven de kans dus dat een substitutie plaats vindt en deze waarde kan je gebruiken in een alignement.

Wat verteld de bit score ?

Hoe groot de data base zou moeten zijn om een match bij chance te vinden.

Geef de formule om de E-value te bepalen?

- De lager de E-value is de kleiner de kans dat je iets vindt bij chance.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo