Meten aan moleculen en cellen middels absorptie en verstrooiing van licht

14 belangrijke vragen over Meten aan moleculen en cellen middels absorptie en verstrooiing van licht

Welk verschil kun je zien bij de transmissie van DNA en eiwit?

DNA heeft een absorptiepiek bij 260 nm en eiwit heeft een piek bij 280 nm

Waar hangt het smeltpunt van DNA vanaf? En wat gebeurt er met de absorptie als het DNA kleiner wordt?

Het smeltpunt hangt af van de C-G en A-T concentratie in het DNA. Kleinere delen DNA zorgen voor een hogere absorptie.

Waarom is de smelttemperatuur van DNA van belang?

Tm is de temperatuur waarbij de ssDNA/dsDNA-verhouding 50/50 is. De smelttemperatuur is van belang om meer te weten te komen over de A/T-rijkheid van het DNA, voor toepassingen als de PCR (polymerase chain reaction, waarbij DNA verhit wordt, er ssDNA ontstaat waaraan primers binden, en zo nieuwe dsDNA's ontstaan)
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Wat kan worden gemeten met circulair licht? En welke 2 formules worden daarvoor gebruikt?

Daarmee kan de secundaire structuur van het eiwit worden bepaald, maar niet exact. 

Hoe maak je onderscheid tussen dsDNA en ssDNA?

Er is onderscheid te maken tussen ssDNA, dsDNA en mononucleotiden: deze hebben namelijk respectievelijk een oplopende absorbantie. ssDNA ontstaat door dsDNA op te warmen.

Wat is er te zeggen over lichtverstrooiing bij DNA?

Hetzelfde als besproken in college 2: hoe kleiner de diffusieconstante, hoe groter het complex. Denk hierbij aan τ ~ 1/D en Rh = (kT)/(6πηD)

Met welke techniek meet je de optische dichtheid van cellen?

Verstrooiing

Wat is te zien aan de optische dichtheid van het monster bestaande uit cellen?

Bij een exponentieel toenemende dichtheid vindt er celdeling plaats. Bij een stationaire fase is de celdeling gestopt of staat tijdelijk stil.

Wat kan je zeggen over de fysisch chemische karakters van eiwitten?

De aanwezigheid van Tryptofaan (Trp), Tyrosine (Tyr) en Histidine (His) geven eiwit een sterke absorptiepiek in UV bij 280 nm. Met deze informatie kan de zuiverheid van een DNA-isolaat bepaald worden

Wat kunnen forward scattering en side scattering je vertellen?

Forward scattering meet de deeltjes grootte en side scattering meet de deeltjes complexiteit.

Wat is circulair dichroisme

Circulair dichroisme treed op bij circulair gepolariseerd licht. Chirale moleculen leveren verschillende absorptie van links- en rechts gepolariseerd licht op: Δε = εL - εR

Dit wordt meestal uitgedrukt in molaire ellipticiteit, ϑ
ϑ = 3298,2 * Δε

Dit is een karakteristiek signaal voor een specifieke secundaire structuur (bijvoorbeeld alfahelix, betasheet). Het levert echt géén volledige structuur van een eiwit op, alleen inzicht in de aanwezigheid van structurele elementen

Hoe kunnen cellen in bacteriële culturen "geteld" worden?

Met een OD560/600/660 meting. Deze meet geen absorptie, maar lichtverstrooiing. OD600 = 1,0 ~ 8 * 10^8 cellen. Hiermee kinnen we een log-lin plot maken van het aantal cellen tegen de tijd. Dit geeft een lag phase, log phase (exponential growth), en een stationary phase.

Wat zijn de verschillende toepassingen van Flow Cytometry?

  1. 'Forward scattering': deeltjesgrootte
  2. 'Side scattering': deeltjescomplexiteit
  3. Fluorescentie: aantal deeltjes
Door deze tegen elkaar te plotten krijg je 'gating': het verkrijgen van een selectie van subpopulaties in een heterogeen sample (dus scheiding van cellen basically)

Wat is FACS sorting precies?

Een aanvulling op cytometry-analyse; cellen kunnen gesorteerd worden voor:
  • verdere analyse (homogeen monster)
  • verrijking ten behoeve van celcultures

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo