Samenvatting: Massaspectrometrie En Proteomics

Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van Massaspectrometrie en Proteomics

• 1 The Fundamentals of Mass Spectrometry

• 1.1.2 Processes in the Mass Spectrometer

• Welke vier secties kan een massaspectrometer bevatten en waarvoor zijn deze van belang?

  1. Inlet sectie: hier worden de analyten toegepast.
  2. Ioniserende sectie: de analyten worden gescheiden van het draagmedium en gebracht naar de gasfase om accurate massa metingen te kunnen doen. 
  3. Transporteren en manipuleren: hier kunnen ionen van specifieke m/z waarden worden gefilterd of specifiek worden gefragmenteerd. Tijdens de transportatie zijn er frequent collisions tussen de ionen, wat kan leiden tot verlies. Dit wordt voorkomen door hoog vacuüm te gebruiken. 
  4. Massa detectie: metingen van de massa door verschillende massa analysers

• 1.1.3 Resolution, Resolving Power and Mass Accuracy

• Welke eigenschap voor een massaspectrometer is relevant om de verschillende compounds van elkaar te onderscheiden en hoe wordt dat gedefinieerd?

  Resolving power, dit is het geval wanneer de dmp = dm.
  dmp is de breedte van de piek bij halve hoogte.
  
  Resolving power = m2/(m2-m1)

• Welke eigenschap beschrijft de breedte van een piek op een alternatieve manier en hoe wordt dit uitgedrukt?

  Peak resolutie = m1/dmp

• Welke eigenschap zorgt ervoor dat de massaspectrometer de exacte massa van een analyt kan bepalen en hoe wordt deze uitgedrukt?

  Massa accuracy = ((2x(mexp - mexact))/(mexp+mexact)) x 10^6
  
  Met mexp is de experimenteel gemeten massa en mexact de theoretische massa.

• 1.1.4 Isotopes

• Wat kan ervoor zorgen dat er ingewikkelde isotoop patronen ontstaan?

  Verschillende elementen hebben (meerdere) stabiele isotopen met verschillende abundantie niveaus.

• 1.1.5 Charge and Mass Determination from Isotopes and Charge State Envelopes

• Hoe kan de lading van een analyt worden bepaald wanneer de lading van het ion hoger dan 1 is?

  Z = 1/verschil in m/z tussen twee isotoop pieken in MS1 spectrum
  
  Wanneer de resolutie te laag is om het isotooppatroon te onderscheiden:
  
  z = (m/z2)/(m/z2-m/z1)

• 1.2 Ionization Methods

• Hoe kan er een accurate en efficiënte massa meting worden gedaan met gebruik van ionisatie?

  Er moet geen draagmedium meer aanwezig zijn om een accurate metingen te doen. Om te zorgen dat de analyten efficiënt kunnen bewegen kun gasfase staat, moeten de analyten naar een ionische vorm worden gebracht zodat ze makkelijk kunnen worden gemanipuleerd met behulp van een elektrisch veld.

• 1.2.1 Electron Impact Ionization

• Op wat voor principe berust  EI?

  Het genereren van elektronen die worden versneld in de ionisatiebron. De analyt wordt gebombardeerd met deze elektronen, wat zorgt voor het verlies van elektronen van de analyt en verkrijgen van positieve kationen.

• Wat zijn drie karakteristieke eigenschappen van EI zijn bepalend voor de keuze van de ionisatie methode bij een analyt?

  De efficiëntie is afhankelijk van hoe goed een elektronen van de analyt kan worden gekaatst door de versnelde elektron.
  
  De structuur is bepalend of een analyt kan gaan fragmenteren, omdat het een harde ionisatie techniek is. Dit kan gebeuren wanneer de energie bij de ionisatie hoger is dan nodig is voor de fragmentatie. Hierom worden  er voornamelijk kleine en vluchtige moleculen gebruikt voor deze methode.

• 1.2.2 Chemical Ionization

  Dit is een preview. Er zijn 2 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1.2.2
  Laat hier meer flashcards zien

• Welk probleem kan Chemical Ionization oplossen dat EI ondervindt en hoe wordt dit opgelost?

  Moleculair ion is wel aanwezig maar met lage intensiteit of volledig absent door fragmentatie. Deze techniek voorziet ionen die representatief zijn aan het mengsel, maar niet identiek.