Mass Spectrometry Based Proteomics - Mass Spectrometry (MS)-Bases Proteomics

5 belangrijke vragen over Mass Spectrometry Based Proteomics - Mass Spectrometry (MS)-Bases Proteomics

Welke drie strategiëen kunnen worden gebruikt bij MS-based proteomics?

Bottom-up/shot-gun: digestie van eiwitten tot peptiden
Top-down: intacte eiwit
Middle down: grotere peptiden of kleine eiwitten

Hoe kan de gehele sequentie worden bepaald door de Top-down approach te gebruiken?

Het intacte en gefragmenteerde eiwit worden gemeten, waarbij de gehele status van het eiwit intact blijft behouden (PTMs en sequentie variaties). Vervolgens kan met het massaverschil de sequentie worden bepaald.

Waarom leidt het tot problemen om veel en grote eiwitten te hebben bij Top-down?

Alle eiwitten hebben verschillende fysiologische eigenschappen, wat het lastig kan maken om hen allemaal te scheiden, dus kan er beter van één of enkele eiwitten gebruikt gemaakt worden bij Top-down.

Eiwitten met hoog moleculair gewicht zorgen voor vele isotooppieken en ESI zorgt voor vele ladingen, deze twee eigenschappen leiden tot vele pieken en overlap. Dit probleem wordt groter bij hogere massa's.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Welk voordeel van Bottum-up leidt er toe dat het een veel gebruikte techniek is?

Het gemak van het hanteren van kleinere peptiden die gemakkelijk kunnen worden gescheiden door LC en efficiënt gedetecteerd door ESI-MS.

Welke drie grote factoren belemmeren eiwit identificatie bij Bottom-up?

1. De complexiteit van het cellulaire proteoom
2.  De dynamische range waarin eiwitten aanwezig zijn in de biologische samples
3. Sensitiviteit van de techniek voor eiwitten met lage abundantie

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo