Mass Spectrometry Based Proteomics - Quantitative Approaches - Chemical Labeling

4 belangrijke vragen over Mass Spectrometry Based Proteomics - Quantitative Approaches - Chemical Labeling

Op welk principe berust chemisch labelen?

Reactieve groepen van peptiden en eiwitten introduceren zware isotopen.

Hoe werken isotopische tags en wat zijn de voor-en nadelen?

Analoog aan SILAC, verrijkt door zware isotopen dat resulteert in een massa shift van de gelabelde peptiden dat kan worden gebruikt om kwantificatie uit te voeren op MS1 niveau. ICAT laat cysteïnes reageren, maar dan moet het eiwit deze wel bevatten. Dimethyllabeling komt ook veel voor waarbij alle primaire amines worden geconverteerd. Dit heeft een wijde range (ug -mg) en lage kosten (snel en efficiënte labeling). Nadelen zijn gelimiteerd multiplexen,  mixen van peptide leidt tot verhoogde complexiteit.

Wat is een groot nadeel van chemical labeling ten opzichte van metabolic labeling?

Verschillende samples kunnen worden gemixt na de digestie, dus labeling wordt gescheiden uitgevoerd, wat leidt tot een hogere variatie.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Wat is het voordeel van isobaric tags ten opzichte van isotopische tags en hoe werkt dat?

Toename van multiplexing zonder de MS1 scans complexiteit te verhogen. Hierbij kunnen 10 in TMT of 8 in de iTRAQ gelijktijdig geanalyseerd. Isobraic labels introduceren een label dat altijd dezelfde massa heeft, hij bestaat uit drie onderdelen: reacteieve groep, reporter en balancer groep. De massa tussen deze onderdelen is wisselend waardoor er na fragmentatie verschillende labels kunnen worden onderscheiden. De reporter ionen in de lage m/z regio worden dan gebruikt voor kwanitifcatie. Nadeel: reporterionen te lage m/z waarde voor sommige MS apparaten en inteferentie van contaminanten die de accuraatheid verminderen.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo