Startpagina / Samenvattingen / Medical genomics / dna-heterochromatine-histon

Genome structure

Q: Waar bestaat een histon octameer uit?

Eiwit met 8 subunist: H2A H2B H3 H4

26 belangrijke vragen over Genome structure

Hoe lang is DNA "fully strechted"?

2 meter lang

Welke DNA regios zijn compacter dan andere regio's in het DNA

Compact:

regio's zonder genen
innactieve genen

minder compact:

actieve genen

TIjdens welke fasen van de cellcycles is het DNA het meest compact?

Tijdens mitose:
- metaphase

- anaphase

Wat is facultative heterochromatin?

DNA delen die zich zowel heterochromatine als in euchromatine vorm voorkomen

Waar in de nucleus zit het grootste deel heterochromatine?

Aan de rand van de nucleus (bij nucleair envelope)

Hoe kan een DNA streng interacteren/ "binden" met een histon?

mbv. Electrostatische interacties
DNA= negatief geladen (door fosfaat groep)
Histon= positief geladen (door basische aminozuren)

Waar bestaat een histon octameer uit?

Eiwit met 8 subunist:

Hoeveel bps zitten er in 1 neucleosome?

147

Hoe heet de DNA formatie waarbij er meerdere nucleosomes gevormd zijn?

"beads on a string"

Hoe worden chromatin fibers gevormd?

Histon eiwit H1 bindt met nucleosomes (op de plek waar het DNA de nucleosome enters/ exits)

Wat is de functie van HATs (histone acetyltransferases)?

Het bindt een acetyl groep aan positief geladen histon tails
de histon tail zal niet meer binden met DNA
hierdoor wordt het DNA toegankelijk voor transcriptie (toegankelijk voor transcriptie factoren en transcriptie initiatie complexen)

Wat is de functie van HADs (histone deacetylase enzymes)?

Haalt de acetyl groep weer van een histon tail --> zorgt dus voor inhibitie van transcriptie

Hoe ontstaat coiled chromatin?

chromatine loops die worden gevormd door MARs

Waar zitten de meeste clusters met MARs?

Dichtbij de nucleair envelope

Welke vorm neemt het chromatine aan rondom scafholding sites in de nucleus?

Roos-vormig

Hoe worden G-band van een chromatide onderzocht?

metaphase chromosomes worden behandeld met trypsine
daarna vindt er Giemsa staining plaats

Welke banden zijn donkergekleurd bij G banding?

Heterochromatine

Hoe worden R-bands van een chromatide onderzocht?

met behulp wat een "heat treatment"
hierbij ontstaat er bandjes tegenovergesteld van G-banding

Zijn centromeren rijk aan heterochromatine of aan euchromatine?

Heterochromatine met weinig genen

Hoeveel bp is een centromeer ongeveer?

220 bp

Wat is de sequentie repeat van telomeren?

TTAGGG

Wat is een T-loop en hoe wordt het gevormd?

De DNA telomeer overhang (is single stranded) bindt aan een complementaire sequence ergens anders op het DNA --> een T-loop ontstaat

Wat is het voordeel van een T-loop?

zorgt voor stabiliteit
zorgt dat de telomeren niet worden afgebroken door enzymen

Wat is de Haflick limit?

Het fenomeen waarbij cellen maar een bepaalde hoeveelheid kunnen delen (50-60) doordat de telomeren steeds korter worden na elke deling

Bij welke cellen komt telomerase tot expressie?

Embryo stamcellen
kanker cellen

Wat is chromosome painting?

Een methode waarbij elk chromosome met een (ander) fluorescente probe wordt gelabeld om te onderzoeken waar in de nucleus de chromosomen voorkomen

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

Medical genomics

Bekijk samenvatting

Een unieke studie- en oefentool
Nooit meer iets twee keer studeren
Haal de cijfers waar je op hoopt
100% zeker alles onthouden

Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.

Studiemateriaal generieke omslagafbeelding