Hoofdindeling dierenrijk
3 belangrijke vragen over Hoofdindeling dierenrijk
Fologenetische boom data
- wordt gebaseerd op RNA en DNA sequencing
- hiervoor wordt ribosomaal, mitochondriaal en nuclear DNA gebuikt
- door sequencen van het genoom wordt de data zichtbaar
- dit is niet gelijk een betekenis -> alleen sequentie van letters
- betekenis is ook erg afhankelijk van wel gedeelte van het genoom is gebruikt, of de informatie relevant is en hoe stabiel het genoom is
- hiervoor wordt ribosomaal, mitochondriaal en nuclear DNA gebuikt
- door sequencen van het genoom wordt de data zichtbaar
- dit is niet gelijk een betekenis -> alleen sequentie van letters
- betekenis is ook erg afhankelijk van wel gedeelte van het genoom is gebruikt, of de informatie relevant is en hoe stabiel het genoom is
Splitsen van twee soorten
- orthologe genen kunnen worden gevonden
- is gerelateerd aan genduplicatie in de voorouder
- vergelijken -> de tijd waarin de soorten uit elkaar zijn gegaan kan worden geschat
- is gerelateerd aan genduplicatie in de voorouder
- vergelijken -> de tijd waarin de soorten uit elkaar zijn gegaan kan worden geschat
Algoritmes fylogenetische boom
- parsimonic based -> gebaseerd op de minste veranderingen -> wel hoge rekenkracht nodig
- distance based algoritme -> berekend op basis van vergelijkbaarheid van operational taxonomical units (OTUs) -> neigbour-joining en balanced minimal evolution (BME) -> snelle betrouwbare methode
- likelihood based algoritme -> gebaseerd op een vooraf bepaald wiskundig model -> beschrijft evolutionair proces -> erg betrouwbaar als goede wiskundige modellen worden gebruikt -> tijd berekenen zal verhogen bij complexere modellen -> maximum likelihood en bayesian methods
- distance based algoritme -> berekend op basis van vergelijkbaarheid van operational taxonomical units (OTUs) -> neigbour-joining en balanced minimal evolution (BME) -> snelle betrouwbare methode
- likelihood based algoritme -> gebaseerd op een vooraf bepaald wiskundig model -> beschrijft evolutionair proces -> erg betrouwbaar als goede wiskundige modellen worden gebruikt -> tijd berekenen zal verhogen bij complexere modellen -> maximum likelihood en bayesian methods
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
