Microbial genomics

12 belangrijke vragen over Microbial genomics

Hoe werkt de Sanger method?

  • 1 ssDNA strand wordt toegevoegd aan de mix met benodigdheden
  • DNA synthese vindt plaatst totdat een ddNTP wordt geplaatst  imp dNTP

Hoe werkt (NGS) next generation sequencing?

  • Kleine DNA stukken met adapters (oligonucleotiden) aan elke uiteinde
  • beide adapters per DNA bindt aan solid substrate--> 1 daarvan "bindt" met een primer
  • PCR zorgt voor kopie van eenzelfde fragment
  • mbo fluorescentie kom je achter de sequentie van de fragmenten
  • de sequentie van de fragmenten overlappen --> hierdoor kom je achter de orginele DNA sequentie

Wat is een ander woord voor NGS?

Massively parallel sequencing techniques
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Wat is whole-genome shotgun sequencing?

Random delen van een genome worden individueel gesequenced
--> de nucleotide sequence worden op de goede "plek" gezet door te kijken naar overlappende delen

Wat zijn voordelen van NGS?

  • Goedkoper
  • sneller
  • efficient
    • 100% van de genomic fragments met adapters binden aan de solid substrate

Wat is single cell genomic sequencing?

Een methode waarbij:
  • Er worden copies gemaakt van het genome van 1 cell
    • mbv MDA (muliple displacemnet amplification)
  • Daarna wordt er NGS gebruikt

Wat zijn 2 manieren om hoeveelheid gen expressie van bepaalde genen te onderzoeken?

  • DNA microassays
  • RNA-seq

Wat is de meest gebruikte methode in proteomics?

Two-dimensional gel electrophoresis

Hoe werkt two dimensional gel electrophoresis?

Mix met eiwitten worden gescheiden van elkaar
--> niet alleen op basis van moleculair weight

  1. isoelectric fusing  (horizontaal)
    • eiwitten gaan door een pH gradient
  2. molecular weight --> voltage   (verticaal)

Wat is een van de meest gebruikte technieken om protein-DNA interactie te onderzoeken?

met EMSA (electrophoretic mobility shift assay)

Wat is een andere naam voor EMSA?

Gel shift assay

Waar kijkt comparative genomics naar?

Het vergelijkt genomes van verschillende organismen (kijken naar verschillen en overeenkomsten)

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo