Startpagina / Samenvattingen / Moleculaire biologie en recombinant DNA / dna-rna-base

DNA structuur

20 belangrijke vragen over DNA structuur

Waar leidt de deaminatie van 5-methylcytosine toe?

Thymine. NH2 groep vervangen door O en H toegevoegd aan naastgelegen N.

Wat is er te zeggen over cytosine base deaminatie?

Cytosine base deaminatie is zeer frequent in DNA maar wordt enzymatisch herkend en hersteld. Een menselijke cel ondergaat circa 100 onherstelde C - > U/T mutaties per dag! Na 10 jaar is dat ~3.6 105 C->T transversies, en het betreft dan (al) ~0.05% van alle genomische cytosines. Kiembaancellen herstellen deze lesie heel efficiënt! Andere celtypes wat minder.

Wat zijn minor bases of DNA ( gemodificeerde nucleosiden)?

- 5 methylcytidine (van cytosine)
- N6-methyladenosine (van adenine)
- N2-mehtylguanosine (van guanine)
- 5- Hydroxymethylcytidine (van cytosine)

Wat zijn de minor bases van tRNAs?

- Inosine (van adenine, contains base hypoxanthine)
- Pseudouridine (Uracil) (verbinding Ribose C-5 i.p.v. N-1)
- 7- methylguanosine (van guanine)
- 4 Thiouridine (van uracil ) (O vervangen door S)

Wat zijn base tautomeren?

• Bij tautomeren is het onmogelijk om één van de isomeren zuiver in handen te krijgen.
• Eigenschappen van de stof zijn daardoor een gemiddelde van de eigenschappen van de aanwezige tautomeren.

In wat voor tautomersitatie vorm moeten de basen?

Je hebt de enol- en keto- vormen van bases. Eén sleutel voor Watson en Crick was om in te zien dat hun model met de keto- vorm moest.

Wat voor geometrie heeft een fosfaat?

Fosfaat (PO4 ) heeft tetrahedrale geometrie

Wat wordt via enzymatische en alkalische hydrolyse van RNA gevormd?

Adenosine 2′-monofosfaat, 3′-monofosfaat, en 2′,3′-cyclic monofosfaat

Wat is cAMP (5’,3’-cyclic)?

is een intracellulaire ‘second messenger’ voor honderden hormonen in eukaryoten. Caffeïne remt de cAMP diesterase die dit afbreekt. Caffeine is ook een antagonist van de adenosine receptoren op het celloppervlak.

Wat voor verbinding heeft de fostaat?

een phosphordiesterverbinding.

Wat zijn eigenschappen van fosfaat-ribose ruggengraat?

Fosfaat-ribose ruggegraat is hydrophiel. Fosfaat heeft negatieve lading by pH7 DNA en RNA zijn dus zuur in H2O. Fosfaat in vivo is gebonden door eiwit, metaal (Na+ , Mg2+) of polyamines

Hoe kan alkalische hydrolyse van RNA worden uitgevoerd?

Alkalische hydrolyse van RNA kan uitgevoerd worden met 0.4 M NaOH. Apurinische DNA sites uit zuur hydrolyse (0.25M HCl) zijn hier ook gevoelig voor omdat ze een 1’OH groep bezitten die dezelfde rol kan spelen als de 2’OH groep van RNA hierboven.

Wat is depurinatie van DNA?

Hydrolyse van de N-B-glycosyl bond tussen de base en de pentose suiker ring genereert abasische sites in het DNA. Dit wordt door lage pH (zuur, 0.25M HCl) sterk bevorderd. Purine bases zijn hier veel gevoeliger voor dan pyrimidines. Geschat : 104 DNA depurinaties per menselijke cel per dag! Deze worden efficiënt herkend en hersteld.

(sites waar geen purines of pyrimidines voorkomen)

Wat zijn de twee watson en crick basenparen?

A -T (twee waterstofbruggen) C - G (drie waterstofbruggen), gekozen om geometrische redenen.

In wat voor conformatie is de glycosyl bond in de A vorm, B vorm en Z vorm?

In A vorm zijn purine en pyrimidine beide anti
In B vorm beide anti
In Z vorm Pyrimidines anti en Purines syn

Wat zijn de Watson en Crick assumpties?

Twee strengen
• Antiparallel
• Rechtshandige dubbele helix
• Hydrofiele ruggengraat van ribose-fosfaat aan de buitenkant
• Furanose ringen als C-2’endo
• Gestackte G≡C en A=T bases aan de binnenkant, loodrecht t.o.v. ruggengraat

Wat was te bepalen uit DNA Röntgendiffractie data?

De meerderheid van reflecties liggen in een kruis. Uit theoretische overwegingen is dit een teken van een helicale structuur. De meridionale reflectie valt op de 10de lijn. Er zijn dus 10 stappen per helix repeat.

Waarom kan RNA niet in de B-vorm duplex voorkomen?

RNA kan niet in de B vorm duplex vanwege sterische hinder tussen de C2’OH en de zuurstofgroepen van het fosfaat in de fosfodiester bond die nucleotides aan elkaar verbinden. In de A vorm, is de pentose in C3’ endo pucker vorm hetgeen de bovengenoemde sterische hinder opheft.

Wanneer zal DNA de A vorm aannemen?

DNA zal de A vorm aannemen in niet physiologische oplossingen met weinig water (Ethanol, etc…)

Wat is Z vorming DNA?

Z DNA is een links draaiende DNA duplex die op bepaalde volgordes rust, met name strikt pur-pyr alternerende sequenties zoals CGTACACG.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

Moleculaire biologie en recombinant DNA

Bekijk samenvatting

Een unieke studie- en oefentool
Nooit meer iets twee keer studeren
Haal de cijfers waar je op hoopt
100% zeker alles onthouden

Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.

Studiemateriaal generieke omslagafbeelding

DNA structuur

20 belangrijke vragen over DNA structuur

Waar leidt de deaminatie van 5-methylcytosine toe?

Wat is er te zeggen over cytosine base deaminatie?

Wat zijn minor bases of DNA ( gemodificeerde nucleosiden)?

Wat zijn de minor bases van tRNAs?

Wat zijn base tautomeren?

In wat voor tautomersitatie vorm moeten de basen?

Wat voor geometrie heeft een fosfaat?

Wat wordt via enzymatische en alkalische hydrolyse van RNA gevormd?

Wat is cAMP (5’,3’-cyclic)?

Wat voor verbinding heeft de fostaat?

Wat zijn eigenschappen van fosfaat-ribose ruggengraat?

Hoe kan alkalische hydrolyse van RNA worden uitgevoerd?

Wat is depurinatie van DNA?

Wat zijn de twee watson en crick basenparen?

In wat voor conformatie is de glycosyl bond in de A vorm, B vorm en Z vorm?

Wat zijn de Watson en Crick assumpties?

Wat was te bepalen uit DNA Röntgendiffractie data?

Waarom kan RNA niet in de B-vorm duplex voorkomen?

Wanneer zal DNA de A vorm aannemen?

Wat is Z vorming DNA?

Samenvattingen die gerelateerd zijn aan DNA structuur

Moleculaire biologie en recombinant DNA

Impact / 1/2 Havo/Vwo / deel Basisboek

The Geo 2

Stichting & vereniging : nieuwe stijl

Chemie Overal (6e editie) 3 VWO

Biologie voor jou 4v leeropdrachtenboek deel…

Biologie & verzorging voor jou : biologie en…

Nova Scheikunde 4 VWO/Gymnasium

Newton : natuurkunde voor de bovenbouw.

Vraag en aanbod lesbrief VWO

Stichting en vereniging/lesbrief/VWO

Literatuur : geschiedenis en theorie VWO 2e …