Regulatie - prokaryoten

8 belangrijke vragen over Regulatie - prokaryoten

Wat is er naast de sigma factor?

Naast sigma factoren zijn er nog 171 E.coli factoren die bepaalde DNA volgordes herkennen in gen-promoters en daar transcriptie remmen (of stimuleren) wanneer gebonden. regulatory proteins

Wat herkennen DNA bindingsdomeinen?

DNA bindingsdomeinen herkennen DNA volgordes in de major groove via waterstofbruggen tussen polaire aminozuren en DNA base zuur- en stikstoffen

Bacteriële repressors remmen meestal de interactie tussen RNA polymerase en de promotor, hoe werkt dit?

Het Trp repressor eiwit bindt promotor DNA als een dimeer gebonden met twee tryptofaan moleculen. Zonder Trp kan TrpR niet aan DNA binden. TrpR is ‘sterker’ dan de holo s-RNA polymerase en represseert haar binding aan het DNA. Dit remt dan transcriptie van de promotor.
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Opstapeling van regulatie bij het Trp operon:

• Het Trp operon wordt op transcriptie intiatie niveau geremd door tryptofaan binding aan de Trp repressor die dan aan de Trp operon promotor bindt en transcriptie van dit biosynthetisch operon remt
• Het Trp operon wordt verder gereguleerd via attenuatie, een leader peptide translatie process dat beladen tRNATrp concentraties kinetisch meet om op transcriptie terminatie niveau Trp operon mRNA productie te remmen

Prokaryotische RNA’s kunnen op meerdere manieren vouwen, wat heeft dit voor effect of de regulatie?

• tRNA-Ribosoom interacties kunnen mRNA vouwing beïnvloeden, en met name terminator hairpins. Dit heet attenuatie
• Aminozuur biosynthese kan op deze wijze gereguleerd via een negatieve feedback loop.
- mRNA moleculen kunnen ook zelf als sensoren voor metabolieten fungeren
• Dit doen ze door metabolieten te binden om alternatieve vouwing te ondergaan

Het genoom van E.Coli ( en de meeste andere prokaryoten) is zeer compact, laat dit zien:

• Proteins 4316
• tRNAs 89, rRNAs 22, Misc RNAs 64 (Signal recognition particle RNA, regulatoire RNAs, …)
• Gemiddelde afstand tussen 2 genen is 118 bp
• Ongeveer 50% van alle E.coli eiwitten worden via polycistronische transcriptie eenheden aangemaakt. De andere helft komt dus op monocistronisch mRNA voor !

Wat zijn silencers/enhancers?

• Bij eukaryoten kunnen cis-acting DNA elementen die door TFs gebonden worden heel ver (100 kb) van de promoter gelegen zijn. Men noemt deze enhancers (+) en silencers (-). Enhancers/silencers maken fysiek contact met de promoters door het tussenliggend DNA ‘uit te lussen’, binnen beperkte DNA domainen. Een operationeel verschil tussen promoters en enhancers/silencers is dat de enhancers/silencers nog steeds werken wanneer men ze omdraait. Darentegen sturen omgedraaide promoters de polymerase de andere streng op. Enhancers/silencers zijn dus orientatie onafhankelijk !!!

Wat biedt eukaryote cellulaire compartimentalisatie?

Veel aangrijpingspunten voor regulatie.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo