Samenvatting: Moleculaire Biologie Practicum

Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van Moleculaire biologie practicum

• 1 Oplossingen bereiden: vakjargon

  Dit is een preview. Er zijn 7 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 1
  Laat hier meer flashcards zien

• Wat is een DNA merker?

  Of DNA ladder 
  mengsel van DNA fragmenten met gekende lengte

• Wat is plasmide DNA

  Dubbelstrengig en circulair 
  komt voor bij eencelligen (prokaryoten en gisten)
  en naast genomisch DNA
  1000 tot 100 000 baseparen

• 3 Scheiden van DNA volgens grootte in een agarosegel

  Dit is een preview. Er zijn 11 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 3
  Laat hier meer flashcards zien

• Oefening 10 keer TEA hoeveel ml nodig

  10 x TEA --> 0..5 x TEA
                    20X 
  1L = 1000ml/20 = 50 ml

• Waarom is DNA negatief geladen

  Door de aanwezigheid van fosfaatgroepen

• Migratie van het DNA is afhankelijk van

  • Grootte 
    
  • agarose concentratie 
  • DNA conformatie van ongeknipt plasmide DNA 
  • Aangelegde spanning 

• Voorkomen ongeknipt plasmide DNA

  3 banden
  

  • Open circulaire vorm: traagst

  • lineair

  • Supercoiled DNA: super opgewonden, migreert het snelst

• Wat is polyacrylamide PAA

  Polymeriseerd niet aan de lucht, daarom tussen 2 verticale platen 
  bovenste laag gaat niet polymeriseren want komt in contact met de lucht

• Capillaire gelelektroforese( scheiding van kleine fragmentjes

  • DNA in fijne buisjes (capillair)
  • gevuld met polymeren op basis van acrylamide.
  • spanningsveld waardoor DNA naar + pool migreert
  • lasergebaseerde detectie DNA fragmenten detecteren

• FIGE (scheiding van grote fragmenten)

  • Field inversion gel elektrophoresis
    
  • meer dan 10 000 bp scheiden 
  • veranderen trager van richten (groot)
  • toestel verandert stroomrichting aantal keer --> beter scheiding 

• 4 Het bereiden van plasmide DNA via een silica-gebaseerde kolom methode

  Dit is een preview. Er zijn 8 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 4
  Laat hier meer flashcards zien

• 5 stappen voor het lyseren van cellen

  1. Isolatie van nucleïnezuren: RNA of DNA uit de staal isoleren
  2. extraxtie van DNA en RNA: RNA verloopt vrij analoog. 
  3. bij DNA moeten eerst de fysieke barieres verbroken worden 
  1. hitte, golven, cruchen of chemische manier of beide 
  2. lysebuffer: open breken --> detergent dat membraan doet oplossen en membraaneiwitten denaturiseert
  3. zouten 
  4. protease
  4. DNA scheiden van andere celcomponenten (eiwitten, suikers)
  1. silicabinding SiO2
  5. DNA, RNA of eiwitlysaat: isoleren RNA of eiwitten of analyseren DNA