Gel-electroforese

10 belangrijke vragen over Gel-electroforese

Welke vormen DNA zijn er en hoe snel migreren ze door de gel heen (langzaam - snel)?

  1. Open circulair
  2. Lineair
  3. Supercoiled
  4. Single stranded

Waarom migreert single stranded en supercoiled DNA sneller door de gel heen als lineair en opencirculair?

Open circulair migreert het langzaamst omdat deze ruimtelijk het grootst is, en migreert daarom het langzaamst waarbij andersom single stranded ruimtelijk het kleinst is en dan dus het snelst door de gel migreert.

Waarom heeft de gel-electroforese buffer een pH van 7.8?

Dit omdat op deze manier de scheiding plaats vindt opbasis van grootte en niet op basis van lading
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Welke controles moeten er meegenomen worden?

  • Positieve controle: waar je zeker weten wat hoort te zien zoals commercieel geknipt pUC18.
  • Negatieve controle: water
  • Een marker om de grootte van de bandjes te bepalen.

Noem de meest voorkomende agrose gel percentages en voor welke grootte bandjes dit is

  • 1% agarose gel = 500 - 10.000 bp
  • 0,7 % agarose gel = 800bp - 12.000bp
  • 2% = 50 bp tot 3000bp

Waarom wordt er TAE (acetaat) / TBE (boraat) buffer gebruikt?

Deze buffer wordt gebruikt omdat op deze manier waterstofbruggen tussen de polymeren van de agarose gevormd kunnen worden waardoor er de porie structuur ontstaat die nodig is om de gel te laten migreren.

Wat zorgt er in de agarose gel voor dat DNA bandjes zichtbaar worden onder de UV-bak?

Gel-red

Waarom voeg je loading dye toe terwijl je ook al gelred aan de gel hebt toegevoegd?

Dit omdat het DNA tijdens de migratie niet zichtbaar is en je wilt wel weten waar het DNA zich bevindt. Om dit dan zichtbaar te kunnen maken wordt er dus loading dye toegevoegd. Daarnaast zorg je er met de loading dye voor dat het DNA zwaar wordt zodat het in de slotjes zakt.

Hoeveel loading dye wil je altijd toevoegen?

Je wilt loading dye altijd 1x van het totaal volume. Dus is de stock 6x en je totaal volume 24 gebruik je 4 uL

Wat is het verschil tussen een kathode en een anode?

De kathode is de negatieve elektrode en de positieve electrode is de anode. De slotjes van de gel moeten dus altijd van aan de kathode zijde zitten zodat het DNA naar de anode zijde kan lopen. DNA is namelijk negatief en anders zou het DNA van de gel af migreren.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo