Sequencing, alignment en BLAST - Sequence alignment
3 belangrijke vragen over Sequencing, alignment en BLAST - Sequence alignment
Wat zijn redenen om sequenties de alignen?
Het grootste doel van alignen is het vergelijken van 1 of meerdere sequenties met elkaar.
- De juiste sequentie te achterhalen van een onbekend gen.
- Diversiteit in beeld brengen van een sequentie.
- Voorspellingen doen over de functie van een gen.
- Verwantschap van genen aantonen.
- Het vinden van soortgelijke genen en/of eiwitten.
Wat is het verschil tussen global alignment en local alignment?
Bij global alignment wordt er een poging gedaan om het volledige genoom te sequencen. Dit kan gebruikt worden wanneer je twee sequenties met elkaar wilt vergelijken die dezelfde lengte hebben, of veel aan elkaar verwant zijn.
Local alignment worden alleen de delen van een sequentie aligned die veel overeenkomsten hebben. Deze kan wel worden gebruikt om sequenties met elkaar te vergelijken die meer van elkaar verschillen, bijvoorbeeld om bepaalde patronen te herkennen tussen de eiwitten.
Wat is het verschil tussen pairwise alignment en multiple alignment?
Pair-wise alignment is het alignen van twee sequenties en multiple alignment is het alignen van meer dan twee sequenties met elkaar.
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden