Startpagina / Samenvattingen / Class notes - Moleculaire celbiologie Theorie (MCB) / sequentie-nucleotide-translated

Sequencing, alignment en BLAST - BLAST - Verschillende soorten BLAST

4 belangrijke vragen over Sequencing, alignment en BLAST - BLAST - Verschillende soorten BLAST

Wat kan je met een nucleotide BLAST

Dit kan je gebruiken wanneer je een nucleotide sequentie hebt die dan geblast wordt (aligned) tegen andere nucleotide sequenties in de data base.

Wat is translated Genomics?

Dit gaat over de omzetting van een DNA sequentie in een mRNA sequentie.

Waarom zou je een blastx willen uitvoeren (translated genomic - protein)?

Dit komt omdat niet alle aminozuren uit dezelfde nucleotide bestaan. Wanneer je dus aminozuren met elkaar wilt vergelijken kun je beter alvast je nucleotide sequentie omzetten in een aminozuren sequentie (translated) en dat dan tegen de data base zetten.

Wat is het verschil tussen een blastx en een tblastn?

Bij een blast x zet je een translated genomic uit tegen de protein database maar bij ten tblastn zet je een protein sequentie uit tegen translated genomics database.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

Moleculaire celbiologie Theorie (MCB)

Bekijk samenvatting