Samenvatting: Moleculaire Detectie 2

Lees hier de samenvatting en de meest belangrijke oefenvragen van moleculaire detectie 2

• Tentamenvragen

  Dit is een preview. Er zijn 27 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 30/01/2020
  Laat hier meer flashcards zien

• Hoeveel primers heb je nodig voor het uitvoeren van een klassieke PRC reactie?

  2 primers

• Wat heeft de grootste invloed op de Tm van de hieronder getoonde probe?5' - TGTGTACGAAACAGAGAA - 3'

  Het GC-gehalte

• Welk van de onderstaande moleculen/reagentia heb je nodig van een sybrGreen qPCR?

  DNTP's, buffer, rev-primers

• Je wil de genexpressie van het huishoudgen GADPH meten. Van een collega krijg je een primerset. Voor de zekerheid besluit je de primers mbv BLAST te checken. De productlengte blijkt te kloppen maar je merkt op dat de Fwd promer zich in het 5'-UTR bevindt van GAPDH en de Rev primer bevindt zich in het tweede exon van GAPDH. De Fwd primer ligt dus niet binnen het ORF.is deze primerset dan wel geschikt om genexpressie van GAPDH mee te nemen?

  De primerset is niet geschikt, de fwd primer moet binnen het ORF vallen

• In een qPCR kun je 2 samples met elkaar vergelijken wat betreft de hoeveelheid van een specifiek stukje DNA dat deze 2 samples bevatten.stel sample A heeft een CT waarde van 26stel sample B heeft een CT waarde van 30welke waarde bevatte meer template DNA?hoeveel keer meer?

  A
  16 keer meer

• transcriptomics

  Dit is een preview. Er zijn 1 andere flashcards beschikbaar voor hoofdstuk 30/01/2020
  Laat hier meer flashcards zien

• Wat is indexeren en waarom doe je het ?

  Indexeren knip je het genoom in stukjes waardoor het mappen sneller gaat

• Wat staat er in een SAM-file

  De lokatie van de reads op welk chromosoom

• NGS

• Welke elementen moet een expressievector bezitten die specifiek zijn voor een goede expressie eiwit?

  Promotor, robisomal binding site, start codon, stop codon en een terminator sequentie.

• Vectoren zijn plasmiden die kunnen worden gebruikt voor genetische modificaties welke 3 onderdelen bevatten nagenoeg alle vectoren?

  Een orgin of replication, een antibioticum resistentie gen, een multiple clining site

• Aangaande het lac operon, als lactose aanwezig is, waar bindt het dan aan?

  Lactose bindt aan de repressor, waardoor de repressor niet meer kan binden aan de operator en de weg vrij is voor RNA polymerase om transcriptie te initieren.