Startpagina / Samenvattingen / moleculaire (onco)pathologie (niet compleet) / methylatie-dna-mgmt

Technieken - methylatie array

3 belangrijke vragen over Technieken - methylatie array

Hoe werkt een methylatie array met illumina infnium methylatie EPIC array?

DNA isolatie en bisulfiet conversie
amplificatie en fragmentatie
hybridisatie aan de beadchip
singel base extensie met een nucleotide met een fluoreescentie label

niet gemethyleerd dan A inbouwing dus rood
wel gemethyleerd dan een G inbouwing dus groen

scannen en data analyse

Wat kan een methylatie array detecteren?

Hypermethylation of genes of interest
High level amplifications
Homozygous gene deletions
Copy number neutral loss of heterozygosity (CN-LOH)

MGMT methylatie status en waarom is dit van belang?

MGMT als die promotor gemethyleerd is dan is die minder actief --> hierdoor kan TMZ (methylatie agent van nuceotiden) niet worden afgebroken dus kan het bij de tumor en schade aanbrengen door het DNA te beschadigen --> De extra schade zorgt ervoor dat tumorcellen dood gaan, maar zorgen voor een verhoogde kans op nieuwe tumoren.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

moleculaire (onco)pathologie (niet compleet)

Bekijk samenvatting