Technieken - SNP array
3 belangrijke vragen over Technieken - SNP array
SNP en wat detecteert een SNP-array
Een SNP is "een variatie in een enkel nucleotide die voorkomt op een specifieke positie in het genoom, waarbij elke variatie in enige mate aanwezig is binnen een populatie (bijvoorbeeld >1%)".
De SNP-array maakt de detectie mogelijk van veel copy number variaties (CNV's), zoals chromosoomverlies en -winst van kleine genomische regio's, of volledige chromosoomarmen of chromosomen.
De SNP-array maakt de detectie mogelijk van veel copy number variaties (CNV's), zoals chromosoomverlies en -winst van kleine genomische regio's, of volledige chromosoomarmen of chromosomen.
Hoe gaat een SNP array (cytoSNP 850K beadchip)?
- DNA isolatie
- DNA fragmentatie en amplificatie
- hybridisatie van amplicon op de bead met een probe voor een specifieke SNP.
- A en T hebben voor het inbouwen een fluorescente tag
- C en G hebben voor het inbouwen een fluorescen
te tag
- niet alle SNPs mogelijk daardoor.
- wassen (overtollig DNA) en scannen
- data analyse
- log ratio en BAF
Verschil tussen aCGH en SNP array?
aCGH is allen voor CNVs --> duplicaties en delecties en de SNP array voor meer dingen. Zie afb.
BRCA tumoren kunnen doormiddel van aCGH![]()
ingedeeld worden in BRCA-1-ness of BRCA-2-ness --> tummor signature bepalen
BRCA tumoren kunnen doormiddel van aCGH
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
