Startpagina / Samenvattingen / Class notes - MTV 3 / dna-testen-antibiotica

Diagnostische microbiologie

51 belangrijke vragen over Diagnostische microbiologie

Vroeger gebruikten ze alleen een kweek, wat hebben ze nu ook?

Moleculaire technieken

Bij een laboratorium indetificatie micro organismen op basis van unieke DNA/RNA sequentie kan je gebruik maken van kloneren van genen, wat houd dit in?

Het maken van identieke kopieen

Bij laboratorium identificatie micro organisme op basis van unieke DNA/RNA sequentie kan je gebruik maken van probe, wat houd dit in?

Gelabled (radioactief of fluorescent) stukje DNA of RNA gebruiken om ander DNA of RNA te identificeren

Welke lading heeft DNA?

Een negatieve lading (dus gaat bewegen naar een positieve lading)

Wanneer stopt een verlening van een keten met sequencing aan een fragment?

Met een H groep, daar kan iets meer aan binden

Wat zijn de voordelen van een PCR?

- gevoelig
- snel
- RNA amplificatie (reverse transcripties)
- vergelijken verschillende genomen
- verschillende toepassingen

Welke polymerase wordt gebruikt bij PCR?

De tak polymerase omdat die hitte stabiel is. (bij het vermenigvuldigen van het DNA ga je hitte gebruiken)

Waar staat denaturatie voor bij PCR?

1 minuut op 94 graden waardoor de strengen van elkaar los laten

Waar staat Hybridisatie voor bij PCR?

45 seconden op 54 graden waardoor de primers binden

Waar staat Extensie voor bij PCR?

Het verlengen van DNA polymerase bij een temperatuur van 2 minuten op 72 graden

Als je een monster afneemt bij een diagnostische cyclus, wanneer doe je dit dan?

Voor de start van de therapie

Wat zijn de stappen bij een diagnostische cyclus?

- Klinische aanvraag + levering klinische informatie
- Veramelen en transport van monsters
- Laboratorium analyse
- Interpretatie microbiologische rapport en toepassen van de informatie

Wat valt er onder immunologische methoden?

- Identificatie organisme
- Detecteren antilichamen en lichaamsvloeistoffen

Wat doe je bij moleculaire technieken?

Gericht de bacterie detecteren

Wat is de samenstelling van kweekmedia?

- Water
- Agar (zorgt voor gele mengsel)
- Groei verrijkende bestanddelen
- Bloed (paard of schaap)

Wanneer noem je een kweekmedium specifiek?

Als je een selectief kweek media maakt, door bijvoorbeeld een antibioticum toe te voegen aan het kweekmedia waardoor sommige specifieke bacterien niet meer kunnen groeien en anderen wel

Wanneer heb je een niet specifiek kweekmedia?

Als je geen selectie toevoegt (antibiotica) en dus in principe elke bacterie kan groeien

Bij laboratorium identificatie van micro organisme op basis van hun unieke DNA/RNA sequentie kan je gebruik maken van restrictie enzym analyse, wat houdt dit in?

Knippen van het DNA met restrictie endunucleases + 'runnen' op elektroforen gel, -> elk organisme heeft een uniek patroon (genetische vingerafdruk)

Wat is het enten van bacterien?

Het uitsmeren op een plaat met bloedagar

Wat houdt een vaste media in bij kweekmethoden?

Voor het verkrijgen van gescheiden kolonie, de losse kolonien kweek je dan op een 2e plaat, dit noem je een reinkweek, dit wordt gebruikt voor biochemische testen

Wat is een voorbeeld van een vaste media kweekmethode?

Bloedagar, en het enten van bacterien.

Is een bloedagar een selectie of niet selectieve kweekmethode?

Inprincipe een niet selectieve kweekmethode maar je kan hem wel selectief maken door het toevoegen van bepaalde stoffen

Wat is de incubatie van agarplaten?

Lichaamstempratuur van 37 graden, en altijd aeroob en anearoob

Wat houdt een vloeibaar media in bij kweekmethode?

- Dat je bacteriegroei bij monsters die al antibiotica hebben gehad weer wilt bevorderen
- Dat je specifieke bacteriën wilt laten groeien maar andere bacteriën wilt onderdrukken (verrijkte media)
- Voor de identificatie: het testen van biochemische activiteit van de bacteriën

Wanneer noemen we het verrijkte media?

Als je bepaalde bacterien juist wilt laten groeien en andere bacterien wilt onderdrukken bij een vloeibare kweekmethode

Wat kun je doen als je de bacteriën isoleert als een reincultuur bij de vaste kweekmethode?

Je kunt de bacteriegroep identificeren
- Je beoordeeld de kolonie kenmerken
- Microscopische beoordeling: morfologie en kleuringseigenschappen
- Je beoordeeld de groei condities

Wat kun je doen als je de bacterien indiceert aan de hand van bacteriesoort bij de vaste kweekmethode?

Je doet biochemische testen
- Kijkt naar het suikerfermentatie en assimilatie profiel
- Je kijkt naar het enzym profiel

Wat doe je als je kijkt naar het suiker fermentatie en assimilatie profiel?

Je gaat de reincultuur incuberen met verschillende suikers, daarna beoordeel je de productie van zuur en gas

Wat is het Analytical Profile Index (API) en AnIdents kits?

Kits met enzym, fermentatie en assimilatie testen

Wat is de methode van een API en AnIdent kits?

De reincultuur wordt geent in elke cupje (met suiker of enzym), dit gaat dan in de nacht incuberen. Daarna kan je de kleur en helderheid vergelijke met een kleurkaart en daar komt een score uit. Dan vergelijk je het cijfer profiel met de cijferprofielen van de bacterie soorten en weet je om welke bacterie het gaat

De serologische testen kan je in 2e onderverdelen, welke 2 zijn dit?

- Venereal diseases of reference laboratory (VDRL)
- Treponemale test

De behandeling met antibiotica kun je in 2e onderverdelen, welke 2 verdelingen zijn dit?

- Empirische therapie
- Rationele therapie

Wat betekend sensitief (gevoelig) bij de gevoeligheid voor antibiotica?

Dat de bacterie is geremd na de toediening van de standaard therapeutische dosis

Wat betekend intermediair bij de gevoeligheid van antibiotica?

Dat de remmende concentratie hoger is dan verkregen bij de therapeutische dosis (je hebt dus net iets meer antibioticum nodig om de bacterie te remmen)

Hoe wordt de primaire gevoeligheid (direct) uitgevoerd bij de antibiotica therapie?

Met een klinisch monster

Hoe wordt de secundaire gevoeligheid (indirect) uitgevoerd bij de antibiotica therapie?

Met een reincultuur

Je hebt 2 soorten antimicrobiele gevoeligheidstesten, welke 2 zijn dit?

- Kwalitatieve test
- Kwantitatieve test

Wat is de eerste stap bij een kwantitatieve test?

Verdunningsreeks antibiotica in bouillon. Je gaat dus kijken wat de minimale concentratie is wat de vitro in de bacteriën remt

- Je gaat het geïsoleerde organisme enten in buisjes, en deze 18 uur incuberen.

Waar staat MIC voor bij de kwantitatief antimicrobiele gevoeligheistest?

Minimale inhibitorische concentratie : de laagste concentratie die de zichtbare groei in vitro remt

Wat is de 2e stap bij een kwantitatieve test?

De ent van de buizen zonder een zichtbare groei ga je nog een keer 18 uur incuberen om te kijken of er toch nog bacteriën te zien zijn, en de plaat waar je daarna dus geen bacteriën meer ziet kun je zeggen dat ze allemaal dood zijn.

Waar staat MBC voor bij de kwantitatieve antimicrobiele gevoeligheidstest?

Minimale bactericide concentratie: laagste concentratie die 99.9% van de micro organisme dood

Voor de virale indentificatie heb je verschillende methode bijvoorbeeld de directe microscopische onderzoek van de gastheerweefsels, wat zie je hierbij en hoe je dit dit?

Detectie virus, virale antigenen of virus geassocieerde veranderingen in de cellen. Dit kun je alleen zien door een elektronen microscopie omdat de virussen te klein zijn om onder een licht microscoop te bekijken

Hoe doe je een virale indentificatie bij de isolatie en identificatie van het virus uit weefsel, secreties (lichaamsvloeistoffen) en exsudaat?

Door een kweek in de levende cellen

Welke moleculaire methoden van virale identificatie heb je?

- PCR
- Probes

Bij Hyfe heb je 2 verschillende soorten, welke zijn dit en wat is het verschil?

- Septate hypha: allemaal cellen aan elkaar maar met een scheidingswand waar de alles doorheen kan
- Aseptate hypha: allemaal cellen aan elkaar zonder scheidingswand ertussen

Wanneer is er sprake van een infectie van schimmels?

Als er grote aantallen aanwezig zijn (iedereen heeft schimmels in zijn lichaam maar dit wordt niet meteen een infectie)

Bij de diagnose van schimmels kan je gebruik maken van een kweek, hoe onderscheid een kweek de candida soorten?

De kolonie kleur verschilt per soort

Bij de diagnose van schimmel infecties kan je gebruik maken van microscopisch onderzoek, wat doe je dan?

Je doet een gram kleuring of je kleurt met PAS (periodic acid Schiff), hierdoor kan je de schimmeldraden (hype) visualiseren en de blatosporen (Budding) zien

Hoe kun je de diagnose van schimmel infecties bepalen?

- Door fermentatie en assimilatie testen
- Kiembuis testen

Wat doe je bij kiembuis testen?

Je ent een geïsoleerde schimmel in serum, die incubeer je 3 uur lang bij een temperatuur van 37 graden en daarna kan je een microscopische onderzoek doen. Bij dat microscopische onderzoek krijg je 2 varianten te zien, de candida met kiemen en de candida zonder kiemen

Welke candidasoorten zijn kiembuizen?

- Candida albicans
- Candida dubliniensis
Deze vormen een korte cilindrische extensie (soort staart)

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

MTV 3

Bekijk samenvatting

Een unieke studie- en oefentool
Nooit meer iets twee keer studeren
Haal de cijfers waar je op hoopt
100% zeker alles onthouden

Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.

Studiemateriaal generieke omslagafbeelding