Startpagina / Samenvattingen / Class notes - Oorzaken van ziekten / dna-sequencing-sequencing-reeksen

Onderzoekstechnieken genetische variatie

5 belangrijke vragen over Onderzoekstechnieken genetische variatie

Een manier om genetische variatie te onderzoeken, is via eiwitelektroforese. Door deze techniek is het aantal detecteerbare polymorfe systemen erg toegenomen. Hoe gaat deze methode in zijn werking?

Deze methode maakt gebruik van het feit dat één verandering van een aminozuur binnen een eiwit een kleine verandering in de
elektrische lading van het eiwit kan veroorzaken. Eiwitten met deze kleine verandering in hun reeks aminozuren zullen anders migreren door een elektrisch geladen gel. De ene kant van de gel is positief geladen en de andere kant is negatief geladen.

Op DNA-niveau kan variatie gevonden worden via Southern blotting en restrictie fragment analyse. Bij deze technieken wordt gebruik gemaakt van bacteriële enzymen. Deze enzymen splijten specifieke reeksen van menselijk DNA. Deze reeksen worden de restrictieplaatsen genoemd. Hoe gaat deze techniek verder in zijn werking?

Deze fragmenten worden vervolgens door middel van gel-elektroforese gesorteerd op hun lengte. Hierbij worden ze onder invloed van een elektrische spanning in een gel op lengte gescheiden. Kleinere fragmenten bewegen sneller door de gel dan grotere, waardoor ze verder van het beginpunt af komen te liggen. Dan worden ze overgedragen naar een solide membraan (een Southern blot), waar ze worden gevisualiseerd door gelabelde probes te gebruiken. De probe wordt gelabeld, vaak met een radioactief isotoop, en vervolgens blootgesteld aan de southern blot.

Welke mutaties worden er gemakkelijk gevonden met de Southern blotting techniek?

Met dit proces kunnen deleties of duplicaties van DNA worden gevonden. Southern blotting heeft een grote rol gespeeld bij de analyse van restrictie-fragment-lengte-polymorfismen (RFLP's), die overal in het menselijk genoom worden aangetroffen als gevolg van normale DNA-sequentie variatie.

Het primaire doel van veel genetische studies is het bepalen van de feitelijke reeks van DNA-baseparen waaruit een gen of een deel van een gen bestaat. Zo'n DNA-sequentie kan veel zeggen over de aard van een specifieke mutatie, de functie van een gen, en de mate van gelijkenis van het gen met andere bekende genen. Wat. Houdt DNA-sequencing in?

DNA-sequencing is een methode die hiervoor wordt gebruikt. De dideoxy (Sanger) methode is een methode voor DNA-sequencing. Deze methode bestaat uit een speciale PCR-reactie gevolgd door gel-elektroforese.

Wat houdt exome sequencing in?

Exome sequencing (of whole-exome sequencing) is een techniek waarbij het volledige genoom van een individu in kaart kan worden gebracht. Hierbij kan genetische variatie ontdekt worden,
bijvoorbeeld ook single nucleotide variants (SNV's). Het wordt gebruikt als conventionele methoden onvoldoende succesvol zijn.

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

Oorzaken van ziekten

Bekijk samenvatting