Quantifying sequences

6 belangrijke vragen over Quantifying sequences

Wat is het verschil tussen identity en similarity?

Identity: het percentage identieke nucleotiden of aminozuren in een alignment (identity matrix).
Similarity: het percentage indentieke aminozuren met een positieve substitutiescore in een alignment (BLOSUM matrix: hoe waarschijnlijk is het dat twee aminozuren in elkaar gemuteerd zijn expected vs observed).

Hoe bepaal je of twee sequenties een gemeenschappelijke voorouder hebben

  • Als sequenties op elkaar lijken is het wss GV met gaps
  • bij meerdere kan je GV sequentie gokken

Hoe wordt gelijkheid tussen sequenties gemeten?

  • gwn tellen
  • homologie kan je niet in keer zeggen, je kan een drempel percentage geven
  • Hogere cijfers + sneller leren
  • Niets twee keer studeren
  • 100% zeker alles onthouden
Ontdek Study Smart

Waarom voeg je gelijkende toe?

Dat je geen bias hebt van hele gelijke alignments om te kijken of het goed alignde homologe zijn

Wat doe je met blosum matrix in verhouding tot models of evolution

Je kijkt of iets wss in elkaar is geevolueerd en hoe waarschijnlijk dat is gebeurd.

Hoe zit een grafiek van een GV over tijd bij de sequentie?

mutationale saturatie ontstaat en gaat naar de 25% toe.f

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

  • Een unieke studie- en oefentool
  • Nooit meer iets twee keer studeren
  • Haal de cijfers waar je op hoopt
  • 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
Trustpilot-logo