Structurele bio-informatica - voorspeling eiwitstructuur - build
3 belangrijke vragen over Structurele bio-informatica - voorspeling eiwitstructuur - build
Wat zijn loop (variable) regions? 1 eerste stap
Zijn het resultaat van inserties/veranderingen tussen de sequenties of de template en de groeve en worden "zonder" enige voorkennis gemodificeerd
Wat zijn de verschillende soorten loops en hoe worden die opgelost? (3)
- Short loops (<3 aa)
kan uitputtend worden gemodelleerd zonder grote computationele vereisten en redelijke nauwkeurigheid. - medium loops (3-10 aa)
kan worden gemodelleerd met behulp van kennis gebaseerde op energiebenaderingen (flankerende residuen, atomaire afstanden), met enigszins redelijke nauwkeurigheid. - long loops
zijn in wezen een kleine versie van het eiwitvouwprobleem en vereisen geavanceerde technieken (fragmentgebaseerde modellering, ab initio-vouwing) die zelden enige garantie op succes bieden
Wat is refinement/verfijning? Stap 3 in build
Is vaak de laaste stap in modeling en streeft ernaar om 'bijna-natieve' modellen dichter bij de echte natieve vouw te brengen. Verrassend genoeg is dit extreem moeilijk om te doen , veel moeilijker zelfs dan het bouwen van een ongeveer correct model van het eiwit te vinden
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden
Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.
