Comparative genetics
6 belangrijke vragen over Comparative genetics
Welke soorten genenkaart zijn er?
- Genetische/koppelings- kaart (recombinatie)
- Cytogenetsiche/fysische kaart (FISH)
- Radiation-hybrid kaart (X-straling)
- Sequentie-kaart (nucleotide volgorde)
Geef een verklaring voor zoogdiergenoomverandering en zoogdiergenoomconservatie
- Herrangschikking van chromosoomsegmenten tijdens de evolutie (breken van chromosomen en verkeerd gaan vastzitten van de chromosoomsegmenten)
- Een aantal koppelingen wordt hierdoor vernietigd (dus niet alles)
- Verwante soorten hebben minder herrangschikkingen; lange geconserveerde stukken. Dier soorten die verwant zijn aan elkaar hebben ook vaak hetzelfde aantal chromosomen.
Hoe kun je bij een fragmentarische genenkaart homologie vast stellen?
- Met behulp van type I merkers (loci die coderen voor genen en geconserveerd zijn over de zoogdiersoorten heen; 90% sequence homologie van de exonen) (BLAST)
- Met behulp van chromosoom painting (FISH met DNA probe afkomstig van een geheel of een gedeelte (arm of specifieke banden) van een chromosoom).
- Hogere cijfers + sneller leren
- Niets twee keer studeren
- 100% zeker alles onthouden
Beschrijf het proces van chromosome painting
- Chromosomen van elkaar scheiden door middel van flow sorting.
- Chromosoomsegmenten maken door middel van microdissectie.
- DNA van een geheel of gedeelte van een chromosoom amplificeren door middel van een specifieke PCR (DOP-PCR = Degenerate Oligonucleotide Primer).
- Product fluorescerend maken.
Wat kun je met chromosome painting?
- Unidirectional - chromosoom paints van diersoort A worden los gelaten op metafase chromosomen van diersoort B.
- Bi-directional = reciprocal chromosoom painting - chromosoom paint van diersoort A worden los gelaten op metafase chromosomen van diersoort B en vice versa.
Wat zijn toepassingen van comparative genomics?
- Geeft inzicht in genoom organisatie en de evolutie van verwante diersoorten.
- Voorspellen van genen betrokken bij de gezondheid van dier en mens.
- Voorspellen van genen betrokken bij economisch relevante kenmerken (worp grootte, melkproductie).
- Levert een belangrijke grondslag voor de validiteit van het dier als model voor de mens.
- Homologie is een grondslag voor het extrapoleren van resultaten van dierproeven naar de mens.
De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:
- Een unieke studie- en oefentool
- Nooit meer iets twee keer studeren
- Haal de cijfers waar je op hoopt
- 100% zeker alles onthouden