Startpagina / Samenvattingen / You should know... Bouwstenen van het leven / zuurstof-affiniteit-t-state

You should know... Protein function

Q: T-state en R-state en de overgang tussen deze states

T-state: zonder zuurstof, 'tense', lage affiniteit R-state: met zuurstof, 'relaxed', hoge affiniteit Molecuul leeg: R naar T state is waarschijnlijker dan T naar R Molecuul met zuurstof: T naar R state is waarschijnlijker dan R naar T. Dus zuurstofbinding verschuift het evenwicht tussen R en T state

9 belangrijke vragen over You should know... Protein function

De kenmerken van fluorescerende eiwitten

Fluorescerende eiwitten bevatten een chromofoor. Dit is een kleurdragend element, het deel van het eiwit dat verantwoordelijk is voor absorptie in het zichtbare en UV-deel kleurenspectrum.
Chromofoor ligt binnen in een beta-barrel zodat het beschermt is tegen invloeden van buitenaf. Fluorescerende proteinen worden gebruikt als biomarkers

Hoe kunnen de fluorescerende proteinen verschillende kleuren hebben?

Dit komt door de samenstelling van de chromofoor. Wanneer er een aminozuur vervangen wordt, ontstaat er een andere structuur en andere absorptie.

Zuurstof bindingskenmerken van myoglobine

Myoglobine is 1 eiwit, een zuurstoftransporter. Wij hebben vooral myoglobine in onze spiercellen. De binding is non-covalent met heemgroepen diie in het centrum een ijzerion vervoeren. De zuurstofbindingen zijn kleine bewegingen van de heemplaat

Zuurstof bindingskenmerken van hemoglobine

Hemoglobine = 4 myoglobine-achtige subunits. Hemoglobine staat zuurstof af in zuurstofarme gebieden. Elke subunit bindt zuurstof apart. De affiniteit hangt af van kleine verschillen in eiwitstructuur.

Wat is en hoe werkt cooperativiteit in zuurstofbinding

Wanneer een ligand gebonden wordt, verandert de affiniteit, afhankelijk van de hoeveelheid ligand die al gebonden is (=cooperativiteit).
Positief: wanneer de affiniteit stijgt door ligand binden
Negatief: wanneer de affiniteit daalt door ligand binden

T-state en R-state en de overgang tussen deze states

T-state: zonder zuurstof, "tense", lage affiniteit
R-state: met zuurstof, "relaxed", hoge affiniteit

Molecuul leeg: R naar T state is waarschijnlijker dan T naar R
Molecuul met zuurstof: T naar R state is waarschijnlijker dan R naar T.

Dus zuurstofbinding verschuift het evenwicht tussen R en T state

Wat is en hoe werkt allosterie

Allosterische regulatie zorgt er voor dat het evenwicht tussen de R- en de T-state verandert.
Allosterisch : "op een andere plek". Wanneer de waarschijnlijkheid van activiteit (R- T-state) van een eiwit verandert door de binding van een effector op een allosterische plek.
Allosterische effectoren prefereren transitie naar T-state, om zuurstof los te laten. Bv wanneer PH verhoogd (zuurder wordt) is er een beetje zuurstof nodig om dit te herstellen (bv met verzuurde spieren)

Thermodynamica van het rekken van elastine

Uitrekken is exotherme reactie, niet spontaan. Er komt orde wanneer je aan het elastiekje trekt dus entropie daalt. Inwendige warmte daalt ook want er komt warmte vrij. Bij het ontspannen na uitrekken ontstaat er weer meer chaos, voorkeur wtb entropie. Wordt weer kouder, inwendige warmte neemt toe (endotherm)

Wat is het bohr effect en welke factoren spelen een rol?

Bohr effect is dat wanneer PH daalt van 7.4 naar 7.2, de bindingsaffiniteit afneemt zodat hemoglobine iets van de gebonden zuurstof loslaat. (bv verzuurde spieren).
Hangt af van
-PH
-temperatuur
-concentratie CO2
-affiniteit

De vragen op deze pagina komen uit de samenvatting van het volgende studiemateriaal:

You should know... Bouwstenen van het leven

Bekijk samenvatting

Een unieke studie- en oefentool
Nooit meer iets twee keer studeren
Haal de cijfers waar je op hoopt
100% zeker alles onthouden

Onthoud sneller, leer beter. Wetenschappelijk bewezen.

Studiemateriaal generieke omslagafbeelding

You should know... Protein function

9 belangrijke vragen over You should know... Protein function

De kenmerken van fluorescerende eiwitten

Hoe kunnen de fluorescerende proteinen verschillende kleuren hebben?

Zuurstof bindingskenmerken van myoglobine

Zuurstof bindingskenmerken van hemoglobine

Wat is en hoe werkt cooperativiteit in zuurstofbinding

T-state en R-state en de overgang tussen deze states

Wat is en hoe werkt allosterie

Thermodynamica van het rekken van elastine

Wat is het bohr effect en welke factoren spelen een rol?

Samenvattingen die gerelateerd zijn aan You should know... : Elements & energies

You should know... Bouwstenen van het leven

Class notes - Vorm en funcite

Class notes - Humane Levenscyclus II

Class notes - Bouwstenen van het Leven

Class notes - Milieu en gezondheid

Class notes - Vorm en funtie

Exploring humans an introduction to the phil…

Psychologie & sociologie : basiscursus

sheets

Leren veranderen

Overheidsfinanciën

Hoofdzaken socialezekerheidsrecht